121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2118 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  100 
 
 
810 aa  1684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  24.22 
 
 
834 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.55 
 
 
741 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.33 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  22.86 
 
 
675 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  22.86 
 
 
770 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.21 
 
 
733 aa  72.8  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.86 
 
 
776 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.86 
 
 
770 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.86 
 
 
797 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.86 
 
 
776 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.22 
 
 
734 aa  72.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.26 
 
 
868 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  23.14 
 
 
758 aa  72  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.19 
 
 
685 aa  72  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  22.27 
 
 
757 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.23 
 
 
700 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27 
 
 
658 aa  67.8  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.41 
 
 
741 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.63 
 
 
691 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.09 
 
 
751 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.21 
 
 
691 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 
729 aa  66.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.95 
 
 
765 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.72 
 
 
708 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.77 
 
 
725 aa  65.1  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 
737 aa  64.7  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.84 
 
 
757 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.48 
 
 
685 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  22.28 
 
 
712 aa  64.3  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.85 
 
 
721 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  22.85 
 
 
733 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.1 
 
 
764 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  22.19 
 
 
706 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.69 
 
 
856 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.09 
 
 
760 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.29 
 
 
740 aa  62  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.01 
 
 
740 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.73 
 
 
719 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.03 
 
 
718 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.24 
 
 
736 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  23.5 
 
 
681 aa  61.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.01 
 
 
741 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.01 
 
 
729 aa  61.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  27.11 
 
 
883 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.43 
 
 
734 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  25.75 
 
 
715 aa  60.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 
676 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.2 
 
 
741 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.77 
 
 
778 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.77 
 
 
717 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.4 
 
 
711 aa  59.3  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.01 
 
 
740 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.01 
 
 
740 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.29 
 
 
740 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  22.04 
 
 
708 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.83 
 
 
731 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.26 
 
 
735 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.75 
 
 
733 aa  58.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.57 
 
 
732 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 
778 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  25.09 
 
 
758 aa  58.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.01 
 
 
740 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.08 
 
 
733 aa  57  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 
778 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.52 
 
 
726 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  26.25 
 
 
734 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.3 
 
 
723 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.63 
 
 
735 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.23 
 
 
722 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.1 
 
 
676 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  20.22 
 
 
786 aa  55.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  27.83 
 
 
647 aa  55.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  23.04 
 
 
727 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  19.77 
 
 
788 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  18.85 
 
 
762 aa  55.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.58 
 
 
736 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  24.35 
 
 
751 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 
734 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.69 
 
 
746 aa  54.3  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.13 
 
 
745 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.07 
 
 
732 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.86 
 
 
734 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.53 
 
 
732 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.62 
 
 
724 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.09 
 
 
751 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  21.77 
 
 
729 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.09 
 
 
751 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  25.21 
 
 
360 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  25.14 
 
 
361 aa  52.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.54 
 
 
604 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.72 
 
 
734 aa  52  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  18.65 
 
 
802 aa  51.6  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.07 
 
 
612 aa  51.2  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  18.15 
 
 
802 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.54 
 
 
776 aa  51.2  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  21.66 
 
 
723 aa  50.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.31 
 
 
716 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.55 
 
 
723 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 
581 aa  50.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>