66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2773 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 734 aa  1526    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  59.89 
 
 		 728 aa  920    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  63.64 
 
 		 734 aa  1000    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  27.97 
 
 		 955 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  27.94 
 
 		 572 aa  177  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  27.61 
 
 		 585 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.15 
 
 		 949 aa  156  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  26.03 
 
 		 801 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 936 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 793 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  24.83 
 
 		 796 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 826 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  26.82 
 
 		 831 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  27.89 
 
 		 831 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 883 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.89 
 
 		 819 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  24.68 
 
 		 1187 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.4 
 
 		 775 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  27.84 
 
 		 856 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.17 
 
 		 787 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  24.95 
 
 		 897 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  24.58 
 
 		 553 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.5 
 
 		 839 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.35 
 
 		 733 aa  98.2  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  25.13 
 
 		 770 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  21.29 
 
 		 796 aa  92  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  21.41 
 
 		 805 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  22.83 
 
 		 910 aa  88.2  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.42 
 
 		 755 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.54 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  19.87 
 
 		 910 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  24.2 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  21.76 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  23.28 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.65 
 
 		 793 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  23.14 
 
 		 876 aa  74.3  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  21 
 
 		 661 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  21.7 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  23.39 
 
 		 1251 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  20.58 
 
 		 926 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  20.65 
 
 		 935 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  23.13 
 
 		 829 aa  68.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  21.31 
 
 		 941 aa  68.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  22.55 
 
 		 904 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.04 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.51 
 
 		 836 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 895 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  21.58 
 
 		 1118 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 		 1107 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  20.6 
 
 		 899 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  21.63 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 880 aa  58.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 556 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  26.25 
 
 		 810 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.16 
 
 		 1507 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  21.78 
 
 		 763 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  20.91 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  20.47 
 
 		 918 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  21.66 
 
 		 909 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  20.44 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  20.92 
 
 		 894 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  25.2 
 
 		 882 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 698 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 776 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1216  hypothetical protein  28.95 
 
 		 585 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>