61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3740 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 
831 aa  1644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  41.41 
 
 
883 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  41.32 
 
 
856 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 
897 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  27.89 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  27.83 
 
 
734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  29.22 
 
 
568 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.47 
 
 
955 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  26.11 
 
 
728 aa  124  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  32 
 
 
661 aa  118  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.19 
 
 
1187 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 
801 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.53 
 
 
796 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 
819 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.28 
 
 
787 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 
775 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.82 
 
 
793 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  25.76 
 
 
826 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 
839 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 
556 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
793 aa  80.1  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1349  hypothetical protein  33.52 
 
 
626 aa  77.4  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.305639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.44 
 
 
733 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  24.81 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.64 
 
 
755 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.22 
 
 
757 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 
936 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.71 
 
 
805 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  25.5 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  29.47 
 
 
949 aa  68.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  24.02 
 
 
572 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  23.75 
 
 
553 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  24.82 
 
 
763 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  27.46 
 
 
831 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.87 
 
 
910 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.14 
 
 
1188 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  25.95 
 
 
757 aa  58.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  28.25 
 
 
810 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  20.74 
 
 
876 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  23.2 
 
 
1251 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  20.09 
 
 
926 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  20.96 
 
 
894 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  22.15 
 
 
916 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  27.32 
 
 
959 aa  51.2  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 
1118 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 
453 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  26.35 
 
 
803 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  32.87 
 
 
801 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  23.08 
 
 
860 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  22.89 
 
 
860 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  24.57 
 
 
836 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  19.31 
 
 
796 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 
759 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  21.33 
 
 
1084 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  26.78 
 
 
2311 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  22.99 
 
 
802 aa  44.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 
1061 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 
910 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.15 
 
 
1429 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  23.53 
 
 
802 aa  44.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0891  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.06 
 
 
582 aa  44.3  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.977532  normal  0.103657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>