70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1216 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 856 aa  1697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  42.58 
 
 		 883 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  41.57 
 
 		 831 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  32.61 
 
 		 897 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  29.08 
 
 		 661 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  30.75 
 
 		 568 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  28.68 
 
 		 734 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.51 
 
 		 955 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25.81 
 
 		 734 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.93 
 
 		 728 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 831 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25 
 
 		 1187 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 572 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 755 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  27.63 
 
 		 949 aa  81.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  24 
 
 		 585 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  26.4 
 
 		 763 aa  77.8  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  26.7 
 
 		 839 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.07 
 
 		 826 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  26.54 
 
 		 936 aa  74.7  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 		 556 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 733 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  27.11 
 
 		 757 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  26.59 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.84 
 
 		 757 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  19.73 
 
 		 787 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  21.37 
 
 		 819 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.78 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  24.54 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  19.54 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  19.11 
 
 		 926 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  20.91 
 
 		 860 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.31 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.35 
 
 		 868 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.32 
 
 		 1507 aa  55.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.06 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  19.09 
 
 		 876 aa  54.7  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  21.54 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  32.11 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  20.32 
 
 		 770 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  35.85 
 
 		 880 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  25.12 
 
 		 931 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  24.05 
 
 		 774 aa  50.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  22.15 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.89 
 
 		 834 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  24.23 
 
 		 660 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  20 
 
 		 860 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  23.72 
 
 		 910 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  23.93 
 
 		 829 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  23.73 
 
 		 851 aa  48.9  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 916 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  23.42 
 
 		 832 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  34.52 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  21.96 
 
 		 941 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  19.64 
 
 		 860 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1216  hypothetical protein  25.17 
 
 		 585 aa  47.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  29.11 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 553 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  32.77 
 
 		 935 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  29.31 
 
 		 904 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0445  hypothetical protein  24 
 
 		 593 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  32.93 
 
 		 1188 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  23.65 
 
 		 941 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1688  hypothetical protein  28.08 
 
 		 811 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0888837 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.25 
 
 		 1429 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  23.64 
 
 		 774 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  20.31 
 
 		 796 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  32.82 
 
 		 859 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.57 
 
 		 805 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  31.73 
 
 		 872 aa  44.3  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>