49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1945 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  54.77 
 
 		 787 aa  910    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  44.92 
 
 		 801 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  44.59 
 
 		 793 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 819 aa  1689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  37.78 
 
 		 796 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  32.41 
 
 		 796 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  33.64 
 
 		 775 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  31.57 
 
 		 839 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  32.02 
 
 		 836 aa  283  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  29.11 
 
 		 805 aa  274  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 793 aa  264  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  25.73 
 
 		 826 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.65 
 
 		 955 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.74 
 
 		 770 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.91 
 
 		 949 aa  119  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.59 
 
 		 734 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  22.44 
 
 		 910 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.17 
 
 		 734 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.28 
 
 		 1187 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.14 
 
 		 936 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  25.16 
 
 		 572 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.53 
 
 		 883 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  20.7 
 
 		 876 aa  80.9  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  21.65 
 
 		 910 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.48 
 
 		 1188 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  25.23 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  24.87 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  20.45 
 
 		 774 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  19.52 
 
 		 916 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.67 
 
 		 1118 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  25.79 
 
 		 909 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  22.89 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.14 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  20.69 
 
 		 923 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  26.47 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  22.58 
 
 		 568 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  19.17 
 
 		 1251 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 855 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.49 
 
 		 1507 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 831 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  18.87 
 
 		 935 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 904 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 1107 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 556 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  18.87 
 
 		 894 aa  46.2  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  19.78 
 
 		 918 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>