197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5663 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  100 
 
 		 1187 aa  2439    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  35.11 
 
 		 770 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  45.93 
 
 		 884 aa  221  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  45.93 
 
 		 957 aa  219  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 615 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  25.88 
 
 		 793 aa  188  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  25.46 
 
 		 801 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  40.57 
 
 		 1141 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  23.29 
 
 		 796 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.29 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.11 
 
 		 728 aa  147  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.46 
 
 		 955 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.15 
 
 		 839 aa  138  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  27.32 
 
 		 734 aa  128  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.62 
 
 		 936 aa  124  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  24.72 
 
 		 775 aa  118  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  24.68 
 
 		 734 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 895 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  22.39 
 
 		 899 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  25.6 
 
 		 733 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  23.59 
 
 		 949 aa  112  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.98 
 
 		 883 aa  112  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  22.45 
 
 		 926 aa  111  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  21.95 
 
 		 910 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 923 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  23.2 
 
 		 876 aa  110  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  23.44 
 
 		 894 aa  107  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 1139 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.94 
 
 		 793 aa  102  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  25.59 
 
 		 1107 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  22.14 
 
 		 916 aa  99.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  52.38 
 
 		 613 aa  96.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  21.41 
 
 		 1251 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.28 
 
 		 819 aa  95.5  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.84 
 
 		 935 aa  95.5  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  21.26 
 
 		 918 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  51.65 
 
 		 726 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  25.43 
 
 		 805 aa  93.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  23.52 
 
 		 757 aa  92.8  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  24.75 
 
 		 836 aa  92.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.96 
 
 		 826 aa  92.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  25.33 
 
 		 897 aa  92.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.76 
 
 		 476 aa  91.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  23.28 
 
 		 909 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.59 
 
 		 755 aa  91.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 856 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  21.47 
 
 		 916 aa  90.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 412 aa  89  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40.3 
 
 		 436 aa  88.6  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.89 
 
 		 472 aa  87.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 		 831 aa  88.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  21.61 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.82 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  20.58 
 
 		 796 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.16 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  21.9 
 
 		 904 aa  85.1  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  49.41 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  48.28 
 
 		 483 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.24 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  38.57 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.08 
 
 		 695 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 401 aa  81.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 503 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  24.11 
 
 		 872 aa  80.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 		 507 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  23.26 
 
 		 829 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  46.43 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  22.43 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.56 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  40 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  21.27 
 
 		 832 aa  77.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 774 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  20.05 
 
 		 910 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 851 aa  77  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.72 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.69 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.88 
 
 		 1188 aa  75.5  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 1259 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  35.29 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.13 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 941 aa  74.3  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 571 aa  74.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  36.57 
 
 		 897 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  39.57 
 
 		 566 aa  74.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.77 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.25 
 
 		 507 aa  73.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  37.16 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  30.72 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  38.85 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  23.12 
 
 		 568 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  36.5 
 
 		 430 aa  71.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  32.21 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  37.93 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  21.26 
 
 		 910 aa  70.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.81 
 
 		 520 aa  70.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.77 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.57 
 
 		 2073 aa  70.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 		 951 aa  69.3  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>