70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2735 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  48.69 
 
 		 1061 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  40.07 
 
 		 860 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  52.64 
 
 		 941 aa  893    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  53.05 
 
 		 935 aa  893    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  85.35 
 
 		 895 aa  1596    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  47.49 
 
 		 909 aa  841    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 899 aa  1826    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  42.53 
 
 		 951 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  42.46 
 
 		 941 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  45.93 
 
 		 918 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  42.81 
 
 		 971 aa  682    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  46.39 
 
 		 904 aa  815    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  40.31 
 
 		 860 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  40.19 
 
 		 860 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  40.31 
 
 		 860 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  43.96 
 
 		 931 aa  629  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  44.11 
 
 		 868 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  34.82 
 
 		 916 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  42.11 
 
 		 901 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.57 
 
 		 1251 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  36.89 
 
 		 894 aa  565  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  44.07 
 
 		 829 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  43.01 
 
 		 859 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34.91 
 
 		 910 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  39.89 
 
 		 855 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  40.48 
 
 		 872 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  39.19 
 
 		 844 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  41.71 
 
 		 880 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.56 
 
 		 905 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.94 
 
 		 876 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.55 
 
 		 1507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  40.46 
 
 		 851 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  41.1 
 
 		 757 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  39.84 
 
 		 832 aa  505  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  39.1 
 
 		 763 aa  492  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  35.91 
 
 		 1429 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  32.94 
 
 		 916 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  35.62 
 
 		 858 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  34.97 
 
 		 1107 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  38.21 
 
 		 873 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  39.39 
 
 		 776 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  38.72 
 
 		 773 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  39.7 
 
 		 774 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  30.95 
 
 		 926 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  37.56 
 
 		 1084 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  35.04 
 
 		 910 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  37.58 
 
 		 776 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  30.5 
 
 		 923 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.92 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.22 
 
 		 914 aa  251  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.8 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  27.02 
 
 		 910 aa  223  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 		 882 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.39 
 
 		 1187 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.39 
 
 		 1188 aa  80.9  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 		 1118 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 757 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 770 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.24 
 
 		 826 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.37 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 733 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  26.61 
 
 		 936 aa  64.7  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.36 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  20.6 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  31.94 
 
 		 1021 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  30.05 
 
 		 955 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  29.19 
 
 		 949 aa  48.9  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.01 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  20.27 
 
 		 839 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>