70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3620 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  43.61 
 
 		 1429 aa  677    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  49.59 
 
 		 855 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  51.27 
 
 		 931 aa  744    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.96 
 
 		 935 aa  680    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  46.99 
 
 		 872 aa  668    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  40.25 
 
 		 909 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  51.75 
 
 		 859 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  41.22 
 
 		 904 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 880 aa  1742    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  50.97 
 
 		 763 aa  713    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  46.45 
 
 		 941 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  59.41 
 
 		 844 aa  918    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  53.6 
 
 		 757 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  51.46 
 
 		 901 aa  726    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  40.93 
 
 		 905 aa  640    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  45.39 
 
 		 1507 aa  684    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  42.82 
 
 		 858 aa  630  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  41.71 
 
 		 918 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  48.7 
 
 		 829 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  46.9 
 
 		 851 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  44.02 
 
 		 832 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  48.44 
 
 		 774 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.39 
 
 		 860 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  34.8 
 
 		 860 aa  569  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.46 
 
 		 860 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  34.31 
 
 		 860 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  41.75 
 
 		 941 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  41.56 
 
 		 895 aa  535  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  41.71 
 
 		 899 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.68 
 
 		 951 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.95 
 
 		 1061 aa  482  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  37.58 
 
 		 910 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  40.72 
 
 		 868 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  39.76 
 
 		 773 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  38.85 
 
 		 776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  37.62 
 
 		 776 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.22 
 
 		 971 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  32.03 
 
 		 894 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  39.44 
 
 		 873 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  31.16 
 
 		 910 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  30.47 
 
 		 876 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  30.29 
 
 		 916 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  29.03 
 
 		 1251 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  33.99 
 
 		 1107 aa  346  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  34.46 
 
 		 1084 aa  346  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.82 
 
 		 774 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.85 
 
 		 926 aa  291  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  25.94 
 
 		 916 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  26.79 
 
 		 923 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.77 
 
 		 914 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  29.12 
 
 		 761 aa  180  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.95 
 
 		 882 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.97 
 
 		 910 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.38 
 
 		 1188 aa  106  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.3 
 
 		 733 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  29.08 
 
 		 1118 aa  75.1  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.6 
 
 		 831 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.88 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.75 
 
 		 757 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.96 
 
 		 1187 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.14 
 
 		 728 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  27.78 
 
 		 883 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.43 
 
 		 955 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.67 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  25.31 
 
 		 801 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.72 
 
 		 856 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  37.25 
 
 		 568 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>