77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0689 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  52.07 
 
 		 904 aa  984    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  53.05 
 
 		 899 aa  893    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  46.51 
 
 		 901 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  47.7 
 
 		 851 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  53.39 
 
 		 895 aa  910    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  45.22 
 
 		 844 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  48.49 
 
 		 829 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  64.84 
 
 		 941 aa  1177    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  45.24 
 
 		 860 aa  782    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  45.96 
 
 		 880 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  40.87 
 
 		 905 aa  651    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  45.55 
 
 		 859 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  54.05 
 
 		 909 aa  1007    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  44.05 
 
 		 872 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 935 aa  1906    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  50.06 
 
 		 931 aa  803    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  39.98 
 
 		 951 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  53.77 
 
 		 918 aa  968    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  44.44 
 
 		 855 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  43 
 
 		 860 aa  782    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  45.48 
 
 		 860 aa  790    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  45.67 
 
 		 860 aa  788    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  45.93 
 
 		 941 aa  785    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  47.05 
 
 		 1061 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.79 
 
 		 971 aa  618  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  44.57 
 
 		 832 aa  618  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  43.91 
 
 		 763 aa  615  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  45.53 
 
 		 757 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  36.49 
 
 		 916 aa  602  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  40.22 
 
 		 1507 aa  599  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  44.18 
 
 		 868 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  35.92 
 
 		 1251 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  35.94 
 
 		 894 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  35.4 
 
 		 910 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.41 
 
 		 1429 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  36.18 
 
 		 876 aa  552  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  38.69 
 
 		 858 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  36.77 
 
 		 910 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  42.63 
 
 		 774 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  36.73 
 
 		 1107 aa  512  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  40.43 
 
 		 1084 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  40.26 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.16 
 
 		 916 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  40.95 
 
 		 776 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  38.61 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  37.43 
 
 		 873 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.51 
 
 		 926 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.71 
 
 		 923 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 		 774 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.4 
 
 		 914 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  29.5 
 
 		 910 aa  261  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.27 
 
 		 882 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.76 
 
 		 761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.62 
 
 		 1188 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.55 
 
 		 733 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.88 
 
 		 757 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.84 
 
 		 1187 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.26 
 
 		 770 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.03 
 
 		 801 aa  81.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.55 
 
 		 755 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.58 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  33.85 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.59 
 
 		 728 aa  71.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  20.65 
 
 		 734 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.23 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  29.71 
 
 		 1118 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.75 
 
 		 836 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 826 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  22.91 
 
 		 883 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  33.78 
 
 		 1021 aa  54.7  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  20.05 
 
 		 839 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  18.87 
 
 		 819 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  24.05 
 
 		 796 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 936 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 949 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.95 
 
 		 831 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  32.77 
 
 		 856 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>