67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2533 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  49.47 
 
 		 844 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  49.73 
 
 		 855 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 851 aa  1717    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  52.25 
 
 		 757 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  50 
 
 		 931 aa  738    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  47.7 
 
 		 935 aa  662    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  53.49 
 
 		 901 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  60.24 
 
 		 829 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  60.66 
 
 		 832 aa  996    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  46.94 
 
 		 941 aa  651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  49.08 
 
 		 763 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  49.6 
 
 		 859 aa  635  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  43.56 
 
 		 909 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  43.21 
 
 		 904 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  43.52 
 
 		 918 aa  622  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  46.14 
 
 		 872 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.64 
 
 		 1507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.09 
 
 		 905 aa  588  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  46.9 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  41.49 
 
 		 1429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  47.09 
 
 		 774 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  41.64 
 
 		 895 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  41.19 
 
 		 858 aa  526  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  41.64 
 
 		 941 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  40.46 
 
 		 899 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.49 
 
 		 1061 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  35.19 
 
 		 860 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  34.39 
 
 		 860 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.99 
 
 		 860 aa  492  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  34.62 
 
 		 860 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.84 
 
 		 951 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  36.45 
 
 		 910 aa  439  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.59 
 
 		 776 aa  435  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.01 
 
 		 971 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  39.89 
 
 		 868 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.13 
 
 		 876 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.91 
 
 		 1084 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  32.96 
 
 		 1251 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 910 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  37.4 
 
 		 873 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  34.38 
 
 		 773 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  31.35 
 
 		 916 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 		 776 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  32.21 
 
 		 894 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  29.5 
 
 		 916 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.93 
 
 		 1107 aa  314  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.77 
 
 		 923 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.15 
 
 		 926 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  28.06 
 
 		 774 aa  283  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.33 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  29.48 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.13 
 
 		 882 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.36 
 
 		 910 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 733 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 770 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.3 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.48 
 
 		 1187 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.16 
 
 		 801 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.38 
 
 		 1118 aa  66.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  26.13 
 
 		 757 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.58 
 
 		 1188 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  21.65 
 
 		 955 aa  54.3  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.61 
 
 		 793 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 572 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.42 
 
 		 796 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 		 839 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  37 
 
 		 883 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>