80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3716 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 801 aa  1628    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  43.27 
 
 		 796 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  54.42 
 
 		 793 aa  859    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  44.94 
 
 		 819 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  42.8 
 
 		 787 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  36.54 
 
 		 796 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  35.51 
 
 		 839 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  35.07 
 
 		 775 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  33.92 
 
 		 805 aa  359  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  33.55 
 
 		 836 aa  343  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  31.24 
 
 		 793 aa  337  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  30.16 
 
 		 955 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.04 
 
 		 826 aa  181  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  25.76 
 
 		 728 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.56 
 
 		 1187 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  26.5 
 
 		 734 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.02 
 
 		 910 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.69 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  30.02 
 
 		 949 aa  141  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 770 aa  134  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  27.54 
 
 		 936 aa  131  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.51 
 
 		 572 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 774 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  27.42 
 
 		 1118 aa  97.8  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.85 
 
 		 1188 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 		 829 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.13 
 
 		 585 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.16 
 
 		 883 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 831 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.35 
 
 		 914 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.19 
 
 		 935 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  20.08 
 
 		 916 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  23.7 
 
 		 901 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 831 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 		 859 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  23.3 
 
 		 897 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  20.68 
 
 		 926 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  24.52 
 
 		 876 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  23.32 
 
 		 851 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  26.16 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  27.24 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  21.59 
 
 		 1251 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 941 aa  71.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 910 aa  71.2  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  23.45 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.98 
 
 		 941 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  20.78 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.18 
 
 		 757 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  24.74 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  23.25 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  26.69 
 
 		 856 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  20.13 
 
 		 909 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  20.39 
 
 		 916 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  25.64 
 
 		 1061 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  22.04 
 
 		 918 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  21.3 
 
 		 832 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  21.34 
 
 		 894 aa  58.5  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  23.89 
 
 		 844 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  21.14 
 
 		 923 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  25 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  22.83 
 
 		 1084 aa  54.7  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.69 
 
 		 1429 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  31.06 
 
 		 761 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  21.22 
 
 		 895 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  26.79 
 
 		 931 aa  51.2  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 556 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.57 
 
 		 1507 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 		 951 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  23.34 
 
 		 872 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  25.31 
 
 		 880 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  22.21 
 
 		 971 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.44 
 
 		 905 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.44 
 
 		 802 aa  48.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  25.86 
 
 		 802 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  21.56 
 
 		 1107 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.21 
 
 		 882 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  29.46 
 
 		 801 aa  45.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>