70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1811 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 923 aa  1921    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  49.51 
 
 		 916 aa  913    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  38.59 
 
 		 926 aa  674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  31.71 
 
 		 935 aa  459  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  31.05 
 
 		 941 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.98 
 
 		 910 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  30.95 
 
 		 918 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.69 
 
 		 1251 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 909 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  31.31 
 
 		 916 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  30.15 
 
 		 860 aa  416  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  29.9 
 
 		 894 aa  416  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  30.46 
 
 		 860 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  29.91 
 
 		 951 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  31.59 
 
 		 904 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  30.5 
 
 		 899 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  31.88 
 
 		 876 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  31.11 
 
 		 860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  30.54 
 
 		 860 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  30.92 
 
 		 1084 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  28.25 
 
 		 895 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  27.8 
 
 		 941 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.18 
 
 		 1107 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  29.35 
 
 		 971 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  28.75 
 
 		 931 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  31.15 
 
 		 868 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  33.11 
 
 		 761 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.65 
 
 		 905 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.15 
 
 		 774 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  29.14 
 
 		 1061 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  27.06 
 
 		 855 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  28.47 
 
 		 859 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  28.24 
 
 		 829 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  28.84 
 
 		 901 aa  315  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.74 
 
 		 914 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  28.77 
 
 		 851 aa  304  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.41 
 
 		 1507 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  26.58 
 
 		 757 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  26.52 
 
 		 844 aa  295  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  26.07 
 
 		 872 aa  291  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  29.04 
 
 		 763 aa  287  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  27.66 
 
 		 832 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  26.59 
 
 		 880 aa  274  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  25.45 
 
 		 773 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  26.1 
 
 		 776 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.03 
 
 		 1429 aa  262  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 910 aa  248  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  26.34 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  26.96 
 
 		 882 aa  241  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  27.96 
 
 		 858 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  28.2 
 
 		 873 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.2 
 
 		 910 aa  209  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  24.63 
 
 		 774 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.87 
 
 		 1187 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.72 
 
 		 733 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 1118 aa  78.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.48 
 
 		 1188 aa  75.1  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  20.88 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.34 
 
 		 936 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  19.11 
 
 		 826 aa  65.1  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  21.18 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.69 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.78 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  20.72 
 
 		 819 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  18.3 
 
 		 839 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.45 
 
 		 883 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  19.58 
 
 		 755 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 949 aa  47.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.03 
 
 		 734 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>