63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0532 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 
936 aa  1898    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 
734 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  27.39 
 
 
801 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 
728 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.84 
 
 
955 aa  127  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  24.62 
 
 
1187 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 
734 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.58 
 
 
949 aa  117  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.14 
 
 
819 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 
826 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.27 
 
 
796 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.8 
 
 
793 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.63 
 
 
831 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.57 
 
 
805 aa  84.7  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.36 
 
 
910 aa  82.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 
1188 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.49 
 
 
883 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  27.25 
 
 
856 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 
787 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 
796 aa  78.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.3 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.48 
 
 
770 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 
839 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  23.81 
 
 
1107 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.55 
 
 
1118 aa  72  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.14 
 
 
793 aa  72  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  22.34 
 
 
923 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  22.72 
 
 
1251 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  23.05 
 
 
553 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 
897 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  26.61 
 
 
899 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 
775 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 
831 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  19.89 
 
 
926 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  26.46 
 
 
895 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  26.87 
 
 
755 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  23.66 
 
 
876 aa  62  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 
951 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.8 
 
 
914 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  24.08 
 
 
585 aa  59.3  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  22.96 
 
 
916 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  21.82 
 
 
910 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.87 
 
 
733 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  22.41 
 
 
661 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  20.44 
 
 
894 aa  53.5  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  24.34 
 
 
832 aa  53.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 
935 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  24.39 
 
 
910 aa  51.6  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  24.37 
 
 
901 aa  51.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  25.36 
 
 
810 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.26 
 
 
734 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.18 
 
 
941 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  21.95 
 
 
860 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  18.41 
 
 
916 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  22.3 
 
 
941 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  22.75 
 
 
931 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 
882 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  22.62 
 
 
860 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.26 
 
 
905 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.43 
 
 
757 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  22.32 
 
 
860 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  19.51 
 
 
836 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>