79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0964 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 770 aa  1595    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  35.11 
 
 		 1187 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  24.63 
 
 		 801 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.91 
 
 		 796 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  23.87 
 
 		 819 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  25.07 
 
 		 793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.94 
 
 		 955 aa  124  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  24.87 
 
 		 876 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  24.69 
 
 		 734 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.68 
 
 		 728 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  24.17 
 
 		 774 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 909 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.87 
 
 		 734 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.39 
 
 		 935 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.13 
 
 		 826 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 926 aa  96.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  24.36 
 
 		 904 aa  94.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 949 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  22.7 
 
 		 910 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 851 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 894 aa  93.2  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  24.46 
 
 		 859 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 1107 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 839 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  22.47 
 
 		 916 aa  84.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.17 
 
 		 941 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 951 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.7 
 
 		 832 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 899 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 		 895 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  20.69 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.27 
 
 		 936 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.67 
 
 		 882 aa  77.8  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 831 aa  77.4  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  21.1 
 
 		 1251 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.14 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  23.15 
 
 		 829 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.75 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.71 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  21.92 
 
 		 923 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.93 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.34 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  21.15 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  21.99 
 
 		 872 aa  66.6  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  21.1 
 
 		 856 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  23.42 
 
 		 971 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  22.93 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  24.23 
 
 		 844 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  20.74 
 
 		 860 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  22.05 
 
 		 916 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  22.03 
 
 		 910 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  22.09 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  20.41 
 
 		 941 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  23.96 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  22.91 
 
 		 931 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.58 
 
 		 1507 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  22.37 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  21.75 
 
 		 860 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 918 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.73 
 
 		 1429 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  20.81 
 
 		 860 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  22.03 
 
 		 757 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  22.41 
 
 		 897 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  21.46 
 
 		 901 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  20.66 
 
 		 860 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  24.77 
 
 		 774 aa  54.7  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.39 
 
 		 831 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.66 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  22.55 
 
 		 1084 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.55 
 
 		 805 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.78 
 
 		 883 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  24.32 
 
 		 568 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 855 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 763 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>