64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2265 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  40.77 
 
 
895 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  40.31 
 
 
899 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  45.17 
 
 
941 aa  803    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  95.58 
 
 
860 aa  1717    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  45.38 
 
 
904 aa  748    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  44.69 
 
 
909 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.67 
 
 
935 aa  788    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  95.93 
 
 
860 aa  1727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  91.98 
 
 
860 aa  1660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  100 
 
 
860 aa  1791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  44.75 
 
 
918 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.29 
 
 
941 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  36.31 
 
 
931 aa  592  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  34.8 
 
 
880 aa  558  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 
844 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  32.88 
 
 
901 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.2 
 
 
951 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  35.14 
 
 
1507 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  33.13 
 
 
971 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  32.68 
 
 
859 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  35.89 
 
 
829 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 
872 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  32.25 
 
 
855 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  34.39 
 
 
851 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.6 
 
 
1429 aa  485  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  33.6 
 
 
832 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  32.32 
 
 
905 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  34.07 
 
 
868 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  35.69 
 
 
776 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  33.41 
 
 
916 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.51 
 
 
773 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  34.56 
 
 
763 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 
757 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 
894 aa  465  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.17 
 
 
876 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.91 
 
 
910 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.05 
 
 
910 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  33.14 
 
 
1251 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.98 
 
 
858 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  34.83 
 
 
1061 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  35.05 
 
 
774 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  34.1 
 
 
776 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  31.06 
 
 
916 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  33.57 
 
 
1084 aa  416  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  30.2 
 
 
926 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  30.46 
 
 
923 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  30.62 
 
 
873 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.04 
 
 
1107 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.74 
 
 
774 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 
882 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.61 
 
 
914 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.97 
 
 
761 aa  213  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  23.22 
 
 
910 aa  184  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.3 
 
 
757 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  20.83 
 
 
733 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.22 
 
 
728 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  20.78 
 
 
1187 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  19.02 
 
 
1188 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  30.07 
 
 
955 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  19.66 
 
 
1118 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.52 
 
 
755 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  20.72 
 
 
793 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.3 
 
 
770 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 
691 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>