75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4080 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  56.22 
 
 		 910 aa  1062    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  54.47 
 
 		 1251 aa  1080    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 916 aa  1888    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  35.37 
 
 		 895 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  36.49 
 
 		 935 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  34.82 
 
 		 899 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  37.64 
 
 		 918 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  36.21 
 
 		 909 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  36.91 
 
 		 876 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  36.45 
 
 		 941 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.18 
 
 		 894 aa  532  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  35.86 
 
 		 904 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.18 
 
 		 916 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  34.06 
 
 		 1107 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.85 
 
 		 951 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 971 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.03 
 
 		 860 aa  475  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.34 
 
 		 926 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  29.64 
 
 		 941 aa  471  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33 
 
 		 860 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.41 
 
 		 860 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.32 
 
 		 1084 aa  456  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  32.36 
 
 		 931 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  32.72 
 
 		 860 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  29.96 
 
 		 901 aa  436  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.31 
 
 		 923 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  30.33 
 
 		 855 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  29.85 
 
 		 859 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  32.02 
 
 		 774 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  30.6 
 
 		 1061 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  29.63 
 
 		 868 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  31.99 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  30.04 
 
 		 872 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  31.35 
 
 		 851 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  31.82 
 
 		 832 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.57 
 
 		 1507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  30.1 
 
 		 880 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.07 
 
 		 1429 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.95 
 
 		 905 aa  352  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  28.55 
 
 		 844 aa  342  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  30.1 
 
 		 858 aa  336  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  29.84 
 
 		 757 aa  336  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  26.61 
 
 		 910 aa  332  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  29.75 
 
 		 763 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  26.23 
 
 		 873 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  27.53 
 
 		 776 aa  295  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  26.74 
 
 		 773 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  25.86 
 
 		 776 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.4 
 
 		 914 aa  278  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  28.08 
 
 		 774 aa  278  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.23 
 
 		 910 aa  231  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.25 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.69 
 
 		 882 aa  194  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.79 
 
 		 733 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.38 
 
 		 1188 aa  98.2  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.53 
 
 		 755 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  20.54 
 
 		 793 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.96 
 
 		 757 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.47 
 
 		 1187 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.31 
 
 		 796 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.59 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  19.97 
 
 		 801 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  19.52 
 
 		 819 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  20.42 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.86 
 
 		 1118 aa  62  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  21.77 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.6 
 
 		 734 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  24.7 
 
 		 836 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  45.07 
 
 		 1021 aa  55.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.82 
 
 		 883 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  19.53 
 
 		 787 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 826 aa  52  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 856 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  18.41 
 
 		 936 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.06 
 
 		 734 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>