73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2781 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 910 aa  1887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  51.26 
 
 		 1251 aa  978    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  56.22 
 
 		 916 aa  1062    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  34.94 
 
 		 894 aa  569  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  35.46 
 
 		 895 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  37.26 
 
 		 941 aa  568  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  35.4 
 
 		 935 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  37.22 
 
 		 876 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  34.74 
 
 		 909 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  34.91 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34.52 
 
 		 918 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34 
 
 		 951 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  33.48 
 
 		 904 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  35.25 
 
 		 1107 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.88 
 
 		 916 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  31.94 
 
 		 941 aa  495  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  33.16 
 
 		 926 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  32.2 
 
 		 971 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  32.11 
 
 		 931 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  32.6 
 
 		 860 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  32.91 
 
 		 860 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  32.75 
 
 		 860 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  32.52 
 
 		 860 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.6 
 
 		 1084 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  32.98 
 
 		 923 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  30.94 
 
 		 901 aa  436  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  32.37 
 
 		 859 aa  409  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.6 
 
 		 905 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  29.94 
 
 		 855 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 851 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  33.64 
 
 		 1061 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  31.42 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  32.96 
 
 		 832 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  30.77 
 
 		 868 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  31.01 
 
 		 872 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  30.04 
 
 		 844 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  31.35 
 
 		 880 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.48 
 
 		 1507 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  28.04 
 
 		 910 aa  358  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  30.93 
 
 		 763 aa  357  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.65 
 
 		 1429 aa  354  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  29.21 
 
 		 757 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  29.4 
 
 		 774 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  26.92 
 
 		 873 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  28.44 
 
 		 858 aa  298  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  27.24 
 
 		 773 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  28.01 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.84 
 
 		 914 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  27.77 
 
 		 776 aa  276  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.6 
 
 		 910 aa  247  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.66 
 
 		 882 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  25.27 
 
 		 761 aa  185  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.93 
 
 		 755 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.33 
 
 		 733 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.7 
 
 		 770 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.04 
 
 		 1118 aa  88.2  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 1188 aa  85.1  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  22.36 
 
 		 955 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  20.05 
 
 		 1187 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  21.65 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.77 
 
 		 757 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  20.91 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  20.95 
 
 		 793 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 		 826 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 787 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.22 
 
 		 796 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  35.37 
 
 		 1021 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.78 
 
 		 936 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 831 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.93 
 
 		 883 aa  51.2  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>