72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3887 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  45.38 
 
 		 860 aa  751    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  46.26 
 
 		 895 aa  806    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  43.95 
 
 		 829 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  46.39 
 
 		 899 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  56.95 
 
 		 909 aa  1072    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 904 aa  1864    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  52.07 
 
 		 935 aa  984    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  40.87 
 
 		 931 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  41.11 
 
 		 880 aa  636    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  39.87 
 
 		 941 aa  719    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  52.98 
 
 		 918 aa  986    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  55.93 
 
 		 941 aa  1006    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  43.32 
 
 		 860 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  44.77 
 
 		 860 aa  750    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  45.38 
 
 		 860 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  40.52 
 
 		 855 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  39.63 
 
 		 901 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  43.21 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  40.02 
 
 		 844 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  39.95 
 
 		 859 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  37.5 
 
 		 951 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  40.26 
 
 		 832 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.59 
 
 		 1507 aa  586  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.35 
 
 		 905 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  41.21 
 
 		 757 aa  571  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  41.15 
 
 		 763 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  37.65 
 
 		 872 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  40.11 
 
 		 1061 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 971 aa  539  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.32 
 
 		 1429 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  36.39 
 
 		 868 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  34.16 
 
 		 1251 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 894 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  36.03 
 
 		 858 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  35.86 
 
 		 916 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  33.62 
 
 		 910 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  33.48 
 
 		 910 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  37.57 
 
 		 774 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.48 
 
 		 876 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.95 
 
 		 776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  33.16 
 
 		 916 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  35.83 
 
 		 776 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  36.02 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.24 
 
 		 1084 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.37 
 
 		 1107 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  31.79 
 
 		 873 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.59 
 
 		 923 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  30.34 
 
 		 926 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  28.63 
 
 		 774 aa  306  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.1 
 
 		 914 aa  277  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 882 aa  206  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.89 
 
 		 910 aa  203  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  25.37 
 
 		 761 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.9 
 
 		 1187 aa  85.1  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.21 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 733 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.94 
 
 		 1188 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.58 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  39.33 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.55 
 
 		 734 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.06 
 
 		 1118 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.92 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.19 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  40.54 
 
 		 1021 aa  62.4  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 819 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 585 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 		 572 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  35.29 
 
 		 787 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  29.31 
 
 		 856 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  19.73 
 
 		 831 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>