72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4105 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  60.74 
 
 		 734 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  56.63 
 
 		 734 aa  889    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 728 aa  1506    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  30.36 
 
 		 572 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  28.57 
 
 		 585 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  26.92 
 
 		 955 aa  185  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  25.76 
 
 		 801 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  25.4 
 
 		 793 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  25.75 
 
 		 796 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  23.47 
 
 		 949 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  24.11 
 
 		 1187 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.78 
 
 		 826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 		 819 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  23.22 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.48 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  23.16 
 
 		 796 aa  128  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 936 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  24.77 
 
 		 897 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.68 
 
 		 831 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 839 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  26.11 
 
 		 831 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.72 
 
 		 883 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.56 
 
 		 733 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.17 
 
 		 755 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  22.72 
 
 		 856 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  24 
 
 		 553 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  24.06 
 
 		 805 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 		 793 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  23.24 
 
 		 661 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.3 
 
 		 770 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.82 
 
 		 1188 aa  87.4  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  24.34 
 
 		 876 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 941 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  21.59 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  21.49 
 
 		 776 aa  77  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 910 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 		 904 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  22.8 
 
 		 860 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  22.92 
 
 		 844 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 832 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.59 
 
 		 935 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  20.45 
 
 		 910 aa  70.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  22.62 
 
 		 757 aa  70.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  20.92 
 
 		 836 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  23.38 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  24.47 
 
 		 951 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 899 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 		 895 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  21.97 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  23.22 
 
 		 860 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  23.18 
 
 		 860 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  22.99 
 
 		 860 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  22.18 
 
 		 1107 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  19.81 
 
 		 894 aa  65.1  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  22.7 
 
 		 1251 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 1084 aa  62.4  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  21.6 
 
 		 1118 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  21.77 
 
 		 916 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 909 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  22.14 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  20.07 
 
 		 901 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  19.64 
 
 		 1061 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  20.76 
 
 		 763 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  20.86 
 
 		 926 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.65 
 
 		 1507 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.14 
 
 		 774 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  23.4 
 
 		 790 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  20.45 
 
 		 774 aa  44.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  23.69 
 
 		 797 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  24.38 
 
 		 810 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.62 
 
 		 746 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>