74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0435 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 910 aa  1835    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  47.76 
 
 		 776 aa  701    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  38.59 
 
 		 941 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  36.77 
 
 		 935 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  37 
 
 		 941 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  38.48 
 
 		 901 aa  525  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  33.62 
 
 		 904 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34.29 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  34.14 
 
 		 909 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  38.09 
 
 		 844 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  36.75 
 
 		 931 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  37.92 
 
 		 859 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  36.42 
 
 		 872 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  37.36 
 
 		 880 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  30.49 
 
 		 860 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  30.05 
 
 		 860 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  30.82 
 
 		 860 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  30.32 
 
 		 860 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  35.59 
 
 		 895 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  35.04 
 
 		 899 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  36.45 
 
 		 851 aa  439  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  34.85 
 
 		 855 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  35.4 
 
 		 868 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 		 763 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  35.47 
 
 		 829 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  36.39 
 
 		 757 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  35.3 
 
 		 832 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  35.11 
 
 		 971 aa  406  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.13 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.15 
 
 		 1507 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  31.63 
 
 		 905 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  36.39 
 
 		 1061 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  29.99 
 
 		 951 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.03 
 
 		 1429 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  30.8 
 
 		 876 aa  372  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  32.97 
 
 		 776 aa  360  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  35.32 
 
 		 774 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  28.04 
 
 		 910 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  29.72 
 
 		 894 aa  352  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  32.68 
 
 		 773 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  26.61 
 
 		 916 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  27.8 
 
 		 1251 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  27.93 
 
 		 916 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.25 
 
 		 774 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  29.79 
 
 		 1084 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  30.19 
 
 		 1107 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  29.33 
 
 		 873 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  23.92 
 
 		 926 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 923 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.98 
 
 		 914 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.66 
 
 		 882 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.52 
 
 		 761 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.99 
 
 		 910 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.83 
 
 		 734 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.98 
 
 		 733 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 734 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.94 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.26 
 
 		 1187 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 801 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  21.97 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  24.88 
 
 		 949 aa  67.4  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.73 
 
 		 1188 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.84 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  59.26 
 
 		 1037 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.68 
 
 		 1118 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.76 
 
 		 757 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 585 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  28.85 
 
 		 826 aa  48.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.84 
 
 		 883 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  32.67 
 
 		 770 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  33.33 
 
 		 1021 aa  46.2  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.68 
 
 		 936 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>