77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1729 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 774 aa  1614    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.27 
 
 		 876 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 910 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  33.04 
 
 		 941 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.78 
 
 		 926 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  32.38 
 
 		 916 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 		 935 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  32.02 
 
 		 916 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 894 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  31.49 
 
 		 895 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.94 
 
 		 1251 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  33.04 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 931 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  32.99 
 
 		 909 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  31.92 
 
 		 899 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 951 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  31.89 
 
 		 1084 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  31.74 
 
 		 860 aa  359  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  30.94 
 
 		 860 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  30.89 
 
 		 860 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  31.26 
 
 		 971 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  30.41 
 
 		 860 aa  351  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.15 
 
 		 923 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  30.09 
 
 		 941 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  29.74 
 
 		 1061 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 901 aa  329  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  30.37 
 
 		 1107 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  28.75 
 
 		 829 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  30.16 
 
 		 763 aa  320  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  30.77 
 
 		 868 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  29.12 
 
 		 859 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  29.24 
 
 		 855 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.98 
 
 		 905 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  28.37 
 
 		 773 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  28.63 
 
 		 904 aa  306  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.23 
 
 		 1507 aa  302  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  28.02 
 
 		 776 aa  301  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.86 
 
 		 1429 aa  299  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  29.26 
 
 		 832 aa  298  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  29.68 
 
 		 880 aa  297  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  28.67 
 
 		 757 aa  296  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  29.25 
 
 		 910 aa  295  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  31.02 
 
 		 844 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  28.06 
 
 		 851 aa  283  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  30.54 
 
 		 872 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.24 
 
 		 914 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 774 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  28.42 
 
 		 776 aa  259  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  26.32 
 
 		 858 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  25.46 
 
 		 882 aa  250  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  26.65 
 
 		 873 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.12 
 
 		 761 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  23.22 
 
 		 910 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 770 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.8 
 
 		 793 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 733 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.93 
 
 		 1188 aa  80.9  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.68 
 
 		 1118 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.86 
 
 		 1187 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 755 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 826 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.3 
 
 		 936 aa  74.3  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.03 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  20.25 
 
 		 819 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 955 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 		 897 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.32 
 
 		 831 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  22.84 
 
 		 949 aa  47.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.14 
 
 		 883 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  19.69 
 
 		 839 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 734 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  21.14 
 
 		 728 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.35 
 
 		 733 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  23.64 
 
 		 856 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  19.84 
 
 		 757 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>