109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2711 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  64.36 
 
 
734 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.3 
 
 
733 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  62.68 
 
 
741 aa  884    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  48.38 
 
 
723 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.64 
 
 
731 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.94 
 
 
732 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  52.34 
 
 
732 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.44 
 
 
735 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  62.36 
 
 
734 aa  861    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  53.53 
 
 
733 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  62.43 
 
 
734 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 
733 aa  1468    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.41 
 
 
778 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  50.92 
 
 
781 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.55 
 
 
764 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.36 
 
 
729 aa  685    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.01 
 
 
778 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  55.76 
 
 
732 aa  768    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  61.85 
 
 
736 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.92 
 
 
729 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.54 
 
 
778 aa  720    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.48 
 
 
765 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  62.06 
 
 
736 aa  844    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.22 
 
 
740 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  45.77 
 
 
770 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  46.82 
 
 
758 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.93 
 
 
740 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.93 
 
 
740 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.77 
 
 
776 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.77 
 
 
770 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.77 
 
 
797 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.77 
 
 
776 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.22 
 
 
740 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  46.94 
 
 
740 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.78 
 
 
740 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.94 
 
 
741 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.31 
 
 
716 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.18 
 
 
717 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  46.36 
 
 
675 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.61 
 
 
759 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.15 
 
 
757 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.78 
 
 
711 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  42.01 
 
 
757 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.64 
 
 
720 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.53 
 
 
698 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.6 
 
 
735 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.25 
 
 
720 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.38 
 
 
725 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  42.16 
 
 
751 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.69 
 
 
721 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.83 
 
 
751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.61 
 
 
751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.77 
 
 
741 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.6 
 
 
741 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.12 
 
 
760 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.01 
 
 
612 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.67 
 
 
751 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.66 
 
 
623 aa  431  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  36.81 
 
 
758 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  34.85 
 
 
727 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.89 
 
 
724 aa  426  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.84 
 
 
723 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.34 
 
 
746 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.82 
 
 
708 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.88 
 
 
719 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.86 
 
 
718 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.32 
 
 
722 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.82 
 
 
700 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.2 
 
 
733 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 
715 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  36.27 
 
 
729 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  37.13 
 
 
723 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.13 
 
 
685 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.54 
 
 
726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  37.84 
 
 
706 aa  353  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.29 
 
 
685 aa  350  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.94 
 
 
734 aa  350  7e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  36.46 
 
 
712 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.56 
 
 
628 aa  340  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  36.7 
 
 
737 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.39 
 
 
658 aa  330  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.1 
 
 
691 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.58 
 
 
691 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  35.37 
 
 
716 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.23 
 
 
682 aa  280  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  34.98 
 
 
645 aa  262  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.67 
 
 
654 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.79 
 
 
776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.9 
 
 
708 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.58 
 
 
689 aa  230  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.42 
 
 
868 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  27.06 
 
 
834 aa  94.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.71 
 
 
732 aa  73.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.08 
 
 
810 aa  57.4  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  21.56 
 
 
581 aa  54.7  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.93 
 
 
676 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  23.33 
 
 
476 aa  52  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  22.03 
 
 
815 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  22.78 
 
 
708 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  48.9  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>