71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4188 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  56.9 
 
 		 941 aa  1025    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  40.33 
 
 		 855 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  56.95 
 
 		 904 aa  1072    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  44.69 
 
 		 860 aa  747    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  44.22 
 
 		 860 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  44.81 
 
 		 860 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 909 aa  1889    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  58.81 
 
 		 918 aa  1108    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  42.29 
 
 		 941 aa  732    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  47.44 
 
 		 895 aa  847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  47.49 
 
 		 899 aa  841    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  54.05 
 
 		 935 aa  1007    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  42.98 
 
 		 931 aa  700    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  45.17 
 
 		 860 aa  752    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  40.25 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  38.11 
 
 		 951 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  43.56 
 
 		 851 aa  631  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  44.91 
 
 		 829 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  39.22 
 
 		 901 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  35.73 
 
 		 971 aa  622  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  39.43 
 
 		 844 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  41.24 
 
 		 832 aa  592  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.1 
 
 		 1251 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  37.28 
 
 		 859 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  40.72 
 
 		 763 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.97 
 
 		 905 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  40.49 
 
 		 757 aa  572  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  40.47 
 
 		 1061 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  36.21 
 
 		 916 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  37.92 
 
 		 872 aa  558  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  36.85 
 
 		 868 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.27 
 
 		 1507 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34.74 
 
 		 910 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.59 
 
 		 1429 aa  542  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  35.12 
 
 		 894 aa  536  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  37.06 
 
 		 876 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  38.84 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  36.96 
 
 		 858 aa  503  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  34.14 
 
 		 910 aa  492  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 916 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.38 
 
 		 1084 aa  485  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.64 
 
 		 776 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  36.81 
 
 		 773 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.02 
 
 		 776 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.81 
 
 		 926 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  33 
 
 		 1107 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  32.82 
 
 		 873 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 923 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  32.99 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.23 
 
 		 914 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.82 
 
 		 910 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.37 
 
 		 882 aa  207  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.42 
 
 		 761 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.26 
 
 		 770 aa  95.1  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.28 
 
 		 1187 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.44 
 
 		 1188 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.33 
 
 		 733 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  21.67 
 
 		 757 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.48 
 
 		 831 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 		 787 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.33 
 
 		 793 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  20.13 
 
 		 801 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  20.58 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.16 
 
 		 755 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  25.79 
 
 		 819 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.55 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.92 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  36.11 
 
 		 1021 aa  56.2  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 826 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.21 
 
 		 734 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>