72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0172 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 894 aa  1816    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  41.85 
 
 		 876 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  35.94 
 
 		 935 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34.94 
 
 		 910 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  34.83 
 
 		 1251 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  36.89 
 
 		 899 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  35.96 
 
 		 895 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  34.77 
 
 		 941 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  36.75 
 
 		 1107 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  35.12 
 
 		 909 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  33.18 
 
 		 916 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 904 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.37 
 
 		 951 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  32.86 
 
 		 971 aa  502  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 918 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 		 941 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 916 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.24 
 
 		 926 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.93 
 
 		 1084 aa  473  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.29 
 
 		 860 aa  465  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.65 
 
 		 860 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  34.13 
 
 		 931 aa  466  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.6 
 
 		 860 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.65 
 
 		 860 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  33.56 
 
 		 868 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  33.63 
 
 		 844 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  33.51 
 
 		 1061 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  32.5 
 
 		 901 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  33.8 
 
 		 859 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.9 
 
 		 923 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  31.56 
 
 		 855 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  32.03 
 
 		 880 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 832 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  33.38 
 
 		 763 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  33.38 
 
 		 829 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  31.67 
 
 		 872 aa  379  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  32.21 
 
 		 851 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.92 
 
 		 905 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  31.15 
 
 		 873 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  29.72 
 
 		 910 aa  352  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  32.19 
 
 		 776 aa  340  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.05 
 
 		 1507 aa  338  3.9999999999999995e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  31.88 
 
 		 773 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.91 
 
 		 914 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  27.7 
 
 		 858 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.98 
 
 		 1429 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  29.48 
 
 		 776 aa  294  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  29.4 
 
 		 774 aa  291  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  26.28 
 
 		 882 aa  253  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.5 
 
 		 910 aa  235  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.81 
 
 		 761 aa  220  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.44 
 
 		 1187 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.82 
 
 		 733 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 755 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.77 
 
 		 1188 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 1118 aa  90.5  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.99 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  28.08 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.94 
 
 		 826 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.37 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  22.1 
 
 		 955 aa  69.3  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  19.81 
 
 		 728 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  45.21 
 
 		 1021 aa  62.4  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.36 
 
 		 801 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 734 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.99 
 
 		 831 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  20.92 
 
 		 734 aa  48.9  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  20.44 
 
 		 936 aa  48.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  18.87 
 
 		 819 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  37.1 
 
 		 896 aa  45.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>