75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3063 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  46.45 
 
 		 880 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  44.82 
 
 		 855 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  56.26 
 
 		 918 aa  1001    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  39.42 
 
 		 951 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  47.79 
 
 		 931 aa  769    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  64.27 
 
 		 935 aa  1180    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  56.9 
 
 		 909 aa  1027    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  55.93 
 
 		 904 aa  1007    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  45.08 
 
 		 860 aa  802    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 941 aa  1916    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  49.25 
 
 		 829 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  43.96 
 
 		 844 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  52.63 
 
 		 895 aa  901    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  46.94 
 
 		 851 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  45.41 
 
 		 901 aa  691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  52.64 
 
 		 899 aa  894    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  46.97 
 
 		 860 aa  799    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  45.04 
 
 		 941 aa  776    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  45.17 
 
 		 860 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  46.27 
 
 		 860 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  39.8 
 
 		 905 aa  632  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  43.91 
 
 		 859 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.9 
 
 		 971 aa  625  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  45.3 
 
 		 757 aa  615  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  43.71 
 
 		 763 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  43.29 
 
 		 832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  42.07 
 
 		 872 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  44.47 
 
 		 1061 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  41.1 
 
 		 868 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  35.73 
 
 		 916 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  37.26 
 
 		 910 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  39.31 
 
 		 1507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.9 
 
 		 1429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  34.77 
 
 		 894 aa  555  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  38.59 
 
 		 910 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  35.54 
 
 		 1251 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  38.19 
 
 		 858 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  37.34 
 
 		 876 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  37.95 
 
 		 1107 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  42.9 
 
 		 774 aa  516  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  38.73 
 
 		 1084 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.93 
 
 		 916 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  38.4 
 
 		 776 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  37.94 
 
 		 773 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  39.66 
 
 		 776 aa  489  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.68 
 
 		 926 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  35.88 
 
 		 873 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.05 
 
 		 923 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.04 
 
 		 774 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.1 
 
 		 914 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 882 aa  258  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  28.21 
 
 		 910 aa  233  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.61 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.61 
 
 		 1187 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.9 
 
 		 733 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.17 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  22.84 
 
 		 955 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.42 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  24.42 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.97 
 
 		 1188 aa  64.3  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.66 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.04 
 
 		 796 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 755 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.52 
 
 		 734 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.33 
 
 		 1118 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  26.33 
 
 		 826 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.87 
 
 		 883 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  23.32 
 
 		 949 aa  51.6  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  36.99 
 
 		 1021 aa  50.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.18 
 
 		 936 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  22.05 
 
 		 793 aa  48.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  22.17 
 
 		 856 aa  47.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0966  hypothetical protein  29.13 
 
 		 691 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>