41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05740 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  62.06 
 
 		 805 aa  1016    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 793 aa  1647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  34.4 
 
 		 836 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  31.24 
 
 		 801 aa  337  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  29.41 
 
 		 793 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  29.53 
 
 		 796 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  30.16 
 
 		 787 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  29.67 
 
 		 819 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  26.77 
 
 		 839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 796 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  25.95 
 
 		 775 aa  187  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  27.97 
 
 		 955 aa  134  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.57 
 
 		 949 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.94 
 
 		 1187 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.69 
 
 		 728 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.77 
 
 		 734 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  27.33 
 
 		 883 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.65 
 
 		 734 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 936 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.93 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.04 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.3 
 
 		 826 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  20.6 
 
 		 755 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  21.68 
 
 		 910 aa  55.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  21.16 
 
 		 832 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  19.82 
 
 		 860 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  21.1 
 
 		 572 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.67 
 
 		 757 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  23.24 
 
 		 568 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.06 
 
 		 770 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.58 
 
 		 733 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  19.55 
 
 		 860 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  21.95 
 
 		 941 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.46 
 
 		 1507 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  20.14 
 
 		 829 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  20.72 
 
 		 860 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 1118 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  20.39 
 
 		 860 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  21.36 
 
 		 872 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  36.11 
 
 		 811 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>