44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6026 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  55.36 
 
 		 819 aa  904    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 787 aa  1632    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  43.19 
 
 		 801 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  42.41 
 
 		 793 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  37.89 
 
 		 796 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  31.87 
 
 		 796 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  33.56 
 
 		 775 aa  399  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  31.61 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  29.33 
 
 		 805 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 		 793 aa  269  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.42 
 
 		 836 aa  244  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  24.29 
 
 		 1187 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.79 
 
 		 826 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.78 
 
 		 955 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.48 
 
 		 728 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 770 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  24.65 
 
 		 949 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 734 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.35 
 
 		 734 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  21.6 
 
 		 910 aa  101  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.4 
 
 		 572 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 883 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 733 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  20.93 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.28 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.28 
 
 		 936 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  20.17 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 		 909 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  21.53 
 
 		 897 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.37 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  20.8 
 
 		 856 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 910 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  23.41 
 
 		 876 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  20.54 
 
 		 755 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.77 
 
 		 831 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  25.91 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  19.52 
 
 		 1251 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  19.53 
 
 		 916 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  21.1 
 
 		 1118 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  24.1 
 
 		 926 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 		 1061 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  35.29 
 
 		 904 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 556 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>