68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4418 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 826 aa  1616    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  27.53 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.8 
 
 		 796 aa  194  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  26.07 
 
 		 819 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  28.05 
 
 		 801 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 793 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  29.12 
 
 		 955 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.04 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.78 
 
 		 728 aa  134  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  29.66 
 
 		 949 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.03 
 
 		 734 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  24.06 
 
 		 775 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.53 
 
 		 734 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.6 
 
 		 1187 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.82 
 
 		 836 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  25.27 
 
 		 796 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 		 936 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.79 
 
 		 770 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  23.14 
 
 		 894 aa  85.5  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  26.06 
 
 		 831 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.47 
 
 		 883 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.01 
 
 		 805 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 		 971 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 774 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.35 
 
 		 910 aa  74.3  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  20.57 
 
 		 926 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  20.85 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  27.55 
 
 		 895 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.07 
 
 		 856 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  27.33 
 
 		 899 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  26.45 
 
 		 829 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 941 aa  67  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.88 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  19.11 
 
 		 923 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  21.56 
 
 		 951 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.96 
 
 		 553 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  25.8 
 
 		 1061 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  22.17 
 
 		 1107 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  23.2 
 
 		 1084 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  21.48 
 
 		 909 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  23.59 
 
 		 935 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  45 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  25.85 
 
 		 941 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  28 
 
 		 757 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  24.15 
 
 		 763 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  27.04 
 
 		 859 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  33.15 
 
 		 872 aa  54.3  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  21.78 
 
 		 876 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  20.61 
 
 		 757 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.74 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 916 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  28.57 
 
 		 776 aa  51.2  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  29.63 
 
 		 681 aa  51.2  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 831 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  27.95 
 
 		 657 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  23.52 
 
 		 1118 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  27.75 
 
 		 873 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  28.85 
 
 		 910 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  29.73 
 
 		 610 aa  48.1  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  29.7 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  38.6 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 		 556 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  30.67 
 
 		 901 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 931 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.57 
 
 		 905 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>