65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2019 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  46.27 
 
 
941 aa  800    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  40.19 
 
 
899 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  90.23 
 
 
860 aa  1626    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  91.98 
 
 
860 aa  1660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  100 
 
 
860 aa  1787    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  91.28 
 
 
860 aa  1641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  43.88 
 
 
918 aa  761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  44.77 
 
 
904 aa  750    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  44.22 
 
 
909 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  43 
 
 
935 aa  782    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  41.36 
 
 
895 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.33 
 
 
941 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  35.9 
 
 
931 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  34.31 
 
 
880 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  33.18 
 
 
859 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.67 
 
 
951 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.95 
 
 
1507 aa  509  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  33.5 
 
 
971 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  32.98 
 
 
844 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  31.72 
 
 
901 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  33.57 
 
 
872 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  36.03 
 
 
829 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.64 
 
 
1429 aa  492  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  32.3 
 
 
855 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  34.62 
 
 
851 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  33.41 
 
 
868 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  34.04 
 
 
832 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  31.76 
 
 
905 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  35.83 
 
 
776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.29 
 
 
773 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.65 
 
 
894 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.6 
 
 
910 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  34.14 
 
 
763 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  33.56 
 
 
876 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  32.46 
 
 
757 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  33.14 
 
 
1251 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.32 
 
 
910 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  35.92 
 
 
1061 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.06 
 
 
858 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  32.72 
 
 
916 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  32.93 
 
 
776 aa  435  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  35.6 
 
 
774 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  30.16 
 
 
916 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  30.15 
 
 
923 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  29.86 
 
 
926 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  30.89 
 
 
873 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  32.96 
 
 
1084 aa  399  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  28.69 
 
 
1107 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.41 
 
 
774 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.43 
 
 
882 aa  235  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.87 
 
 
914 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.84 
 
 
761 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  22.7 
 
 
910 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.8 
 
 
728 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.12 
 
 
733 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  19.9 
 
 
1188 aa  65.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.61 
 
 
757 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20.08 
 
 
1118 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  20.91 
 
 
856 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  20.05 
 
 
1187 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  20.33 
 
 
755 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.67 
 
 
955 aa  51.6  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  20.44 
 
 
770 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  20.39 
 
 
793 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 
691 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>