95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4085 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  42.16 
 
 		 916 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  38.59 
 
 		 923 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 926 aa  1912    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  32.23 
 
 		 895 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  33.16 
 
 		 910 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  31.24 
 
 		 894 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  31.68 
 
 		 941 aa  472  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  31.51 
 
 		 935 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  31.34 
 
 		 916 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.16 
 
 		 1251 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  30.95 
 
 		 899 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  31.81 
 
 		 909 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  31.28 
 
 		 951 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  32.03 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  30 
 
 		 918 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  27.08 
 
 		 971 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  30.2 
 
 		 860 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  30.34 
 
 		 904 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  29.92 
 
 		 860 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  27.85 
 
 		 941 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.78 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  29.86 
 
 		 860 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  31.25 
 
 		 1084 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  29.6 
 
 		 860 aa  399  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.75 
 
 		 1107 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.67 
 
 		 914 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  26.78 
 
 		 931 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  26.37 
 
 		 855 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 901 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  28.89 
 
 		 1061 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  27.01 
 
 		 868 aa  337  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.37 
 
 		 905 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  27.27 
 
 		 872 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  27.9 
 
 		 829 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  26.1 
 
 		 844 aa  313  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.2 
 
 		 1507 aa  312  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  24.8 
 
 		 859 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  26.21 
 
 		 757 aa  310  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  26.15 
 
 		 851 aa  300  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  28.4 
 
 		 763 aa  290  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.99 
 
 		 761 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 832 aa  281  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  26.77 
 
 		 880 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.24 
 
 		 1429 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  23.92 
 
 		 910 aa  266  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  26.72 
 
 		 873 aa  260  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  26.52 
 
 		 882 aa  252  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  28.29 
 
 		 858 aa  249  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  25.1 
 
 		 776 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  25.1 
 
 		 776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  25.13 
 
 		 773 aa  234  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  25.34 
 
 		 774 aa  228  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  22.32 
 
 		 910 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.45 
 
 		 1187 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.52 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.08 
 
 		 793 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  19.34 
 
 		 1188 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  18.86 
 
 		 1118 aa  82.4  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  20.8 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  29.3 
 
 		 755 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.33 
 
 		 883 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  20.57 
 
 		 826 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  37.76 
 
 		 757 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  19.08 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.21 
 
 		 734 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  18.82 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 734 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  19.71 
 
 		 936 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  19.11 
 
 		 856 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  31.82 
 
 		 1021 aa  58.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 831 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.91 
 
 		 734 aa  54.7  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.59 
 
 		 781 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.1 
 
 		 787 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  17.92 
 
 		 775 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.7 
 
 		 734 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  20.86 
 
 		 728 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.74 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.82 
 
 		 723 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.32 
 
 		 729 aa  48.5  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.06 
 
 		 741 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.56 
 
 		 778 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  29.67 
 
 		 938 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.99 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.21 
 
 		 776 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.21 
 
 		 776 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.99 
 
 		 778 aa  45.8  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  27.21 
 
 		 675 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.77 
 
 		 733 aa  45.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.7 
 
 		 764 aa  45.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.01 
 
 		 729 aa  45.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.47 
 
 		 797 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.47 
 
 		 770 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 741 aa  44.3  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>