60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 761 aa  1496    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  32.68 
 
 		 916 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  33.11 
 
 		 923 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  27.99 
 
 		 926 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  32.56 
 
 		 931 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 901 aa  268  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  31.52 
 
 		 829 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  28.12 
 
 		 774 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  27.95 
 
 		 876 aa  249  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  28.8 
 
 		 895 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  30.85 
 
 		 855 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  28.74 
 
 		 941 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  29.07 
 
 		 899 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  27.71 
 
 		 1251 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  32.14 
 
 		 971 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  28.29 
 
 		 935 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  29.4 
 
 		 1084 aa  227  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  25.72 
 
 		 860 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  29.08 
 
 		 894 aa  226  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.61 
 
 		 1429 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  25.53 
 
 		 860 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.69 
 
 		 914 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  31.42 
 
 		 859 aa  223  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  29.76 
 
 		 868 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  25.16 
 
 		 860 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  31.62 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  30.11 
 
 		 1061 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  25.46 
 
 		 860 aa  218  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  28.59 
 
 		 941 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 		 951 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  24.52 
 
 		 916 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  30.17 
 
 		 851 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  25.24 
 
 		 918 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  30.03 
 
 		 872 aa  213  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  25.51 
 
 		 904 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.44 
 
 		 1507 aa  207  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  28.2 
 
 		 832 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  28.99 
 
 		 763 aa  204  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  24.83 
 
 		 909 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  27.73 
 
 		 858 aa  194  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  25.27 
 
 		 910 aa  194  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  28.48 
 
 		 844 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  26.94 
 
 		 776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  28.45 
 
 		 873 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 		 1107 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  25.76 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  28.19 
 
 		 774 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  28.03 
 
 		 910 aa  180  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  29.63 
 
 		 880 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.18 
 
 		 905 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 882 aa  138  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  26.91 
 
 		 1118 aa  84.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.88 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.07 
 
 		 1188 aa  80.9  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  30.86 
 
 		 801 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  26.34 
 
 		 757 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 936 aa  47.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 949 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>