82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1682 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  41.85 
 
 		 894 aa  679    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 876 aa  1810    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  36.91 
 
 		 916 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  37.22 
 
 		 910 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  36.18 
 
 		 935 aa  562  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.22 
 
 		 1251 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  36.29 
 
 		 895 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  37.34 
 
 		 941 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  37.06 
 
 		 909 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  34.94 
 
 		 899 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.58 
 
 		 951 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34.69 
 
 		 918 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  35.02 
 
 		 1107 aa  495  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  34.48 
 
 		 904 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.36 
 
 		 916 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  35.87 
 
 		 931 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  34.17 
 
 		 860 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.36 
 
 		 860 aa  475  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.56 
 
 		 860 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.85 
 
 		 860 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  37.19 
 
 		 1084 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  32.03 
 
 		 926 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 941 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  32.01 
 
 		 901 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  34.27 
 
 		 774 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  30.93 
 
 		 971 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  35.65 
 
 		 832 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  33.98 
 
 		 1061 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  31.62 
 
 		 855 aa  429  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  34.36 
 
 		 859 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  34.13 
 
 		 851 aa  422  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.88 
 
 		 923 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  32.62 
 
 		 872 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  32.85 
 
 		 829 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  31.25 
 
 		 868 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  31.51 
 
 		 844 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.41 
 
 		 905 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  32.49 
 
 		 763 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.8 
 
 		 910 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  29.82 
 
 		 880 aa  379  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  31.17 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.02 
 
 		 1507 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.73 
 
 		 1429 aa  362  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  30.86 
 
 		 773 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  30.83 
 
 		 776 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.24 
 
 		 858 aa  334  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  27.78 
 
 		 873 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  29.3 
 
 		 774 aa  306  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  30.2 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  28.04 
 
 		 914 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.82 
 
 		 761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.93 
 
 		 910 aa  230  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  25.09 
 
 		 882 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.39 
 
 		 1188 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.63 
 
 		 793 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  23.2 
 
 		 1118 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.2 
 
 		 1187 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.74 
 
 		 770 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.53 
 
 		 733 aa  99.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.79 
 
 		 796 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.34 
 
 		 728 aa  90.9  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  21.48 
 
 		 819 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  20.96 
 
 		 839 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.33 
 
 		 734 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.63 
 
 		 883 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  24.52 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.71 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  19.16 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  20.35 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.3 
 
 		 936 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.39 
 
 		 831 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  19.23 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.41 
 
 		 787 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 		 826 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  30.28 
 
 		 1021 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  20.23 
 
 		 836 aa  51.6  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.7 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  21.05 
 
 		 831 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 556 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  20.81 
 
 		 793 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  27.04 
 
 		 585 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>