60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4893 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  38.21 
 
 		 899 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  37.43 
 
 		 935 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  37.89 
 
 		 895 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  36.09 
 
 		 941 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  32.82 
 
 		 909 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34.47 
 
 		 918 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  40.84 
 
 		 1061 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  41.65 
 
 		 971 aa  435  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  39.47 
 
 		 868 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  31.79 
 
 		 904 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  41.12 
 
 		 844 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  31.01 
 
 		 860 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  30.34 
 
 		 860 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  30.62 
 
 		 860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  38.85 
 
 		 931 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  40.69 
 
 		 901 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  30.77 
 
 		 951 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  30.89 
 
 		 860 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  39.66 
 
 		 859 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.98 
 
 		 941 aa  389  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  37.4 
 
 		 851 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  39.44 
 
 		 880 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  37.02 
 
 		 763 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  38.33 
 
 		 855 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.78 
 
 		 773 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.1 
 
 		 776 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  31.23 
 
 		 858 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  35.1 
 
 		 1507 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  37.78 
 
 		 774 aa  364  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  35.79 
 
 		 1429 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  37.1 
 
 		 829 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  31.15 
 
 		 894 aa  355  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  36.44 
 
 		 757 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  35.02 
 
 		 872 aa  350  9e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  35.48 
 
 		 776 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 		 832 aa  343  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  28.34 
 
 		 1251 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.15 
 
 		 905 aa  338  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  26.23 
 
 		 916 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  32.63 
 
 		 1084 aa  320  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  26.92 
 
 		 910 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  27.78 
 
 		 876 aa  298  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  29.33 
 
 		 910 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.72 
 
 		 926 aa  260  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.36 
 
 		 1107 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  26.65 
 
 		 774 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.2 
 
 		 923 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  25.54 
 
 		 916 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.98 
 
 		 914 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.31 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  19.77 
 
 		 882 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  23.54 
 
 		 910 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.09 
 
 		 1118 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.29 
 
 		 1187 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.28 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.81 
 
 		 734 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.62 
 
 		 755 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.1 
 
 		 826 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  19.12 
 
 		 733 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>