73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0426 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  50.74 
 
 		 901 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  49.93 
 
 		 855 aa  701    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  63.49 
 
 		 757 aa  959    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  49.74 
 
 		 931 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  49.08 
 
 		 851 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  53.39 
 
 		 774 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  50.86 
 
 		 844 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  50.59 
 
 		 829 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  45.17 
 
 		 832 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  50.58 
 
 		 880 aa  700    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 763 aa  1545    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  48.34 
 
 		 859 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  46.18 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  43.89 
 
 		 1507 aa  616  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  44.07 
 
 		 905 aa  615  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  44.55 
 
 		 1429 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  43.91 
 
 		 935 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  43.71 
 
 		 941 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  43.01 
 
 		 918 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  40.72 
 
 		 909 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  41.15 
 
 		 904 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  42.44 
 
 		 858 aa  535  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  40.98 
 
 		 895 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.07 
 
 		 1061 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  40.82 
 
 		 941 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.1 
 
 		 899 aa  492  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  34.56 
 
 		 860 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 860 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.56 
 
 		 860 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  34.14 
 
 		 860 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  37.24 
 
 		 776 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.76 
 
 		 971 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.46 
 
 		 951 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.17 
 
 		 776 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 		 910 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  36.18 
 
 		 773 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  37.02 
 
 		 873 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.38 
 
 		 894 aa  386  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  38.2 
 
 		 868 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  34.42 
 
 		 1084 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  32.49 
 
 		 876 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  30.93 
 
 		 910 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.45 
 
 		 1251 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  29.75 
 
 		 916 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.16 
 
 		 774 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  30.11 
 
 		 1107 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  29.02 
 
 		 916 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  28.4 
 
 		 926 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.04 
 
 		 923 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.54 
 
 		 914 aa  233  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.26 
 
 		 761 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.6 
 
 		 882 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.64 
 
 		 910 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.46 
 
 		 733 aa  97.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.16 
 
 		 1187 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.49 
 
 		 1118 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.03 
 
 		 1188 aa  82.4  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.5 
 
 		 955 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  26.4 
 
 		 856 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.85 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 755 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.4 
 
 		 883 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.41 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 831 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  39.29 
 
 		 839 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.78 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.82 
 
 		 831 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  19.85 
 
 		 572 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.57 
 
 		 826 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  20.76 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  23.54 
 
 		 775 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>