64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5609 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 776 aa  1597    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  89.18 
 
 		 773 aa  1442    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  40.95 
 
 		 935 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  38.4 
 
 		 941 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  36.98 
 
 		 918 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  40.51 
 
 		 931 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  36.04 
 
 		 860 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  35.69 
 
 		 860 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  36.18 
 
 		 860 aa  475  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.39 
 
 		 899 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  35.83 
 
 		 860 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  39.18 
 
 		 844 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  38.45 
 
 		 895 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  36.02 
 
 		 909 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  35.83 
 
 		 904 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  38.71 
 
 		 880 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  36.34 
 
 		 829 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  37.67 
 
 		 855 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  38.02 
 
 		 901 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  36.17 
 
 		 763 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  36.15 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  36.13 
 
 		 971 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.57 
 
 		 905 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.66 
 
 		 941 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.27 
 
 		 1429 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  33.84 
 
 		 832 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  35.45 
 
 		 858 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  35.58 
 
 		 872 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.23 
 
 		 1507 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  36.07 
 
 		 859 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  36.1 
 
 		 873 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 		 851 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.74 
 
 		 951 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  36.53 
 
 		 774 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  37.17 
 
 		 1061 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  36.94 
 
 		 868 aa  364  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  31.06 
 
 		 776 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  32.97 
 
 		 910 aa  360  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  32.19 
 
 		 894 aa  340  7e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  30.83 
 
 		 876 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  31.13 
 
 		 1084 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  28.02 
 
 		 774 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  28.01 
 
 		 910 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  25.86 
 
 		 916 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  26.22 
 
 		 916 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  26.1 
 
 		 923 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  28.41 
 
 		 1251 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  25.1 
 
 		 926 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.25 
 
 		 1107 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 761 aa  173  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 882 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.61 
 
 		 914 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.01 
 
 		 1187 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.3 
 
 		 1118 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.54 
 
 		 955 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  23.29 
 
 		 775 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  19.66 
 
 		 831 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  28.57 
 
 		 826 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.11 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.73 
 
 		 770 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.29 
 
 		 755 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.9 
 
 		 1188 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 734 aa  44.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25 
 
 		 910 aa  44.3  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>