72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2783 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  39.87 
 
 		 904 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.93 
 
 		 935 aa  785    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  45.04 
 
 		 941 aa  775    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  44.32 
 
 		 931 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  42.51 
 
 		 895 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  44.46 
 
 		 901 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  42.46 
 
 		 899 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  43.35 
 
 		 918 aa  738    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 941 aa  1918    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  42.29 
 
 		 909 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  35.99 
 
 		 860 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  35.33 
 
 		 860 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  35.32 
 
 		 860 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  35.29 
 
 		 860 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  41.84 
 
 		 859 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  40.42 
 
 		 855 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  35.44 
 
 		 951 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  44.78 
 
 		 829 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  39.62 
 
 		 844 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  37 
 
 		 910 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  40.04 
 
 		 868 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  36.85 
 
 		 971 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  41.75 
 
 		 880 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  38.78 
 
 		 872 aa  528  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.76 
 
 		 1061 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  41.64 
 
 		 851 aa  519  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  40.9 
 
 		 757 aa  516  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 		 894 aa  497  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  40.82 
 
 		 763 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  31.94 
 
 		 910 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.21 
 
 		 905 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  39 
 
 		 776 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  39.68 
 
 		 832 aa  483  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31.15 
 
 		 1251 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  29.64 
 
 		 916 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  38.33 
 
 		 774 aa  452  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.82 
 
 		 1507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 		 1107 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 876 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.82 
 
 		 858 aa  438  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.37 
 
 		 1429 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  29.84 
 
 		 916 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.56 
 
 		 1084 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  27.85 
 
 		 926 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  35.66 
 
 		 776 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35 
 
 		 773 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  35.98 
 
 		 873 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  27.8 
 
 		 923 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.09 
 
 		 774 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  29.04 
 
 		 910 aa  258  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.51 
 
 		 914 aa  248  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.59 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.17 
 
 		 882 aa  185  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 		 733 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.21 
 
 		 1188 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.73 
 
 		 883 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.27 
 
 		 1118 aa  86.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.93 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.86 
 
 		 1187 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.09 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.18 
 
 		 757 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.58 
 
 		 955 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.28 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  36.11 
 
 		 1021 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.16 
 
 		 796 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.39 
 
 		 734 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 949 aa  52.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  20.66 
 
 		 770 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  28.29 
 
 		 936 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  23.65 
 
 		 856 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.05 
 
 		 839 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>