71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1249 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  42.53 
 
 		 899 aa  756    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  41.36 
 
 		 895 aa  740    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  40.11 
 
 		 941 aa  660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 951 aa  1955    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  39.36 
 
 		 918 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  39.98 
 
 		 935 aa  685    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  38.11 
 
 		 909 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  37.5 
 
 		 904 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 		 971 aa  575  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.44 
 
 		 941 aa  563  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  34.91 
 
 		 931 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  34.82 
 
 		 901 aa  549  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  38.23 
 
 		 1061 aa  536  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  35.66 
 
 		 1251 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.91 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.88 
 
 		 860 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  36.13 
 
 		 868 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  34.2 
 
 		 860 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.67 
 
 		 860 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34 
 
 		 910 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.37 
 
 		 894 aa  508  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.58 
 
 		 876 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  33.63 
 
 		 855 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  33.85 
 
 		 916 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  35.17 
 
 		 872 aa  489  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  32.89 
 
 		 916 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  34.56 
 
 		 880 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  34.84 
 
 		 851 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  31.81 
 
 		 859 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  33.07 
 
 		 844 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  32.58 
 
 		 905 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  31.28 
 
 		 926 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  33.12 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.15 
 
 		 1507 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  33.46 
 
 		 763 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.39 
 
 		 1107 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  32.42 
 
 		 858 aa  416  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.91 
 
 		 923 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  31.53 
 
 		 1084 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  30.77 
 
 		 873 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  31.28 
 
 		 1429 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  31.08 
 
 		 757 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  29.99 
 
 		 910 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  33.74 
 
 		 776 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  31.39 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  32.6 
 
 		 773 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.65 
 
 		 774 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  32.12 
 
 		 776 aa  352  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.17 
 
 		 914 aa  253  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.65 
 
 		 910 aa  229  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.31 
 
 		 761 aa  204  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.32 
 
 		 882 aa  164  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  34.62 
 
 		 755 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.86 
 
 		 1188 aa  78.2  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 770 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.38 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.03 
 
 		 757 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20.66 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.47 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.17 
 
 		 1187 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.98 
 
 		 734 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  34.02 
 
 		 733 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.56 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  38.36 
 
 		 1021 aa  60.1  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 		 936 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  18.4 
 
 		 839 aa  50.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.1 
 
 		 801 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.65 
 
 		 796 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  26.09 
 
 		 955 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  27.27 
 
 		 572 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>