90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3741 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 1107 aa  2241    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  36.75 
 
 		 894 aa  544  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  38.06 
 
 		 941 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  35.34 
 
 		 910 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  36.67 
 
 		 935 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 916 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  32.78 
 
 		 1251 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  35.02 
 
 		 876 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  34.97 
 
 		 899 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  34.67 
 
 		 895 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  32.97 
 
 		 909 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  33.33 
 
 		 941 aa  446  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  32.12 
 
 		 904 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34 
 
 		 918 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  31.11 
 
 		 951 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  31.59 
 
 		 916 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  29.39 
 
 		 860 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  32.53 
 
 		 931 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  32.73 
 
 		 901 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  29.04 
 
 		 860 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  28.69 
 
 		 860 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  29.34 
 
 		 860 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  29.75 
 
 		 926 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.23 
 
 		 923 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.81 
 
 		 1084 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  31.13 
 
 		 971 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 859 aa  358  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  32.67 
 
 		 872 aa  347  8e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  32.98 
 
 		 829 aa  343  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  33.42 
 
 		 1061 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  32.44 
 
 		 855 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  33.99 
 
 		 880 aa  326  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  32.7 
 
 		 832 aa  325  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.5 
 
 		 774 aa  324  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.44 
 
 		 905 aa  323  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  32.23 
 
 		 844 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  33.2 
 
 		 851 aa  314  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  30.11 
 
 		 763 aa  308  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  30.94 
 
 		 868 aa  303  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  31.18 
 
 		 757 aa  303  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.2 
 
 		 1507 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.19 
 
 		 910 aa  283  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  27.71 
 
 		 858 aa  271  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  29.03 
 
 		 774 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  29.47 
 
 		 873 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.54 
 
 		 1429 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.98 
 
 		 910 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  29.25 
 
 		 776 aa  243  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  28.86 
 
 		 776 aa  235  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  28.77 
 
 		 773 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  31.85 
 
 		 897 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.69 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 882 aa  180  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 		 761 aa  170  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  43.84 
 
 		 524 aa  135  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  34.52 
 
 		 765 aa  121  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.02 
 
 		 1118 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.72 
 
 		 1188 aa  111  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  49.22 
 
 		 128 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.3 
 
 		 757 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  24.89 
 
 		 755 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.59 
 
 		 1187 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  25.32 
 
 		 733 aa  94.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.13 
 
 		 955 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.15 
 
 		 770 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  30.25 
 
 		 184 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.53 
 
 		 793 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.81 
 
 		 936 aa  69.7  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  48.33 
 
 		 763 aa  67  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.18 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.34 
 
 		 1577 aa  61.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  44.64 
 
 		 760 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  28.69 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  36.49 
 
 		 1021 aa  59.7  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.5 
 
 		 949 aa  59.3  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  28.99 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.41 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.85 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  25.82 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  44.64 
 
 		 743 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 734 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 839 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  40.32 
 
 		 430 aa  55.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  41.18 
 
 		 550 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  28.73 
 
 		 883 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 819 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  21.36 
 
 		 572 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.62 
 
 		 801 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 		 848 aa  45.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>