70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3580 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  43.35 
 
 		 941 aa  738    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  45.93 
 
 		 899 aa  791    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  53.77 
 
 		 935 aa  968    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  42.69 
 
 		 931 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  46.95 
 
 		 895 aa  801    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  39.36 
 
 		 951 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 918 aa  1898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  41.11 
 
 		 901 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  56.26 
 
 		 941 aa  999    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  58.81 
 
 		 909 aa  1108    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  44.56 
 
 		 860 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  43.88 
 
 		 860 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  44.75 
 
 		 860 aa  772    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  45.35 
 
 		 860 aa  779    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  41 
 
 		 855 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  52.98 
 
 		 904 aa  986    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  41.27 
 
 		 844 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  43.52 
 
 		 851 aa  622  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  44.38 
 
 		 829 aa  621  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  41.49 
 
 		 880 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  43.01 
 
 		 763 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  42 
 
 		 757 aa  598  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  38.54 
 
 		 859 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  39.24 
 
 		 872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  38.89 
 
 		 971 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.6 
 
 		 905 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  41.03 
 
 		 832 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.32 
 
 		 1507 aa  571  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  37.64 
 
 		 916 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  42.02 
 
 		 1061 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 		 1251 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  39.35 
 
 		 858 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.81 
 
 		 1429 aa  535  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  36.58 
 
 		 868 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34.52 
 
 		 910 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  34.14 
 
 		 916 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 894 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  39.54 
 
 		 774 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  34.29 
 
 		 910 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  38.02 
 
 		 776 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.98 
 
 		 776 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.69 
 
 		 876 aa  482  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  37.65 
 
 		 773 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  36.11 
 
 		 1084 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  34.47 
 
 		 873 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  30.95 
 
 		 923 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  34 
 
 		 1107 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  30 
 
 		 926 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  33.04 
 
 		 774 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.36 
 
 		 914 aa  250  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.81 
 
 		 910 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.97 
 
 		 761 aa  203  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.61 
 
 		 757 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.26 
 
 		 1187 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 733 aa  91.3  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.15 
 
 		 1188 aa  81.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 793 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 755 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  23.39 
 
 		 949 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 		 1118 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  20.47 
 
 		 734 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  20.29 
 
 		 955 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.38 
 
 		 770 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  32.88 
 
 		 1021 aa  51.6  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.73 
 
 		 796 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 572 aa  48.9  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.4 
 
 		 883 aa  48.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  19.78 
 
 		 819 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>