84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3974 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  50.5 
 
 		 757 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 733 aa  1518    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  44.85 
 
 		 755 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.96 
 
 		 910 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 801 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.64 
 
 		 1188 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.6 
 
 		 1187 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.19 
 
 		 1118 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  24.52 
 
 		 926 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.56 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  22.82 
 
 		 894 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  23.79 
 
 		 916 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  22.59 
 
 		 1084 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 		 941 aa  100  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  23.55 
 
 		 935 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  22.09 
 
 		 757 aa  98.6  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.08 
 
 		 734 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.35 
 
 		 734 aa  97.8  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.46 
 
 		 763 aa  97.4  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  24.42 
 
 		 829 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  25.32 
 
 		 1107 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  24.33 
 
 		 910 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  21.88 
 
 		 776 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 918 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 883 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  21.53 
 
 		 876 aa  89.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 916 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  22.04 
 
 		 855 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 		 844 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.06 
 
 		 1429 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 851 aa  87.8  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  21.98 
 
 		 910 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.9 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 872 aa  86.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 774 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  22.43 
 
 		 1251 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 901 aa  85.1  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  23.5 
 
 		 880 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 787 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.09 
 
 		 832 aa  82.4  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  22.72 
 
 		 923 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20 
 
 		 1507 aa  81.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 904 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  22.33 
 
 		 909 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.98 
 
 		 831 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  21.93 
 
 		 839 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  22.05 
 
 		 955 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  25.23 
 
 		 819 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  20.85 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  23 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.38 
 
 		 895 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  42.05 
 
 		 1021 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  23.72 
 
 		 860 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  20.83 
 
 		 860 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  22.42 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  23.12 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  23.19 
 
 		 860 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 899 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  26.67 
 
 		 1061 aa  64.3  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 		 770 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.02 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  23.44 
 
 		 831 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.72 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  22.62 
 
 		 897 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  21.48 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.4 
 
 		 914 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  23.89 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  22.07 
 
 		 796 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  27.68 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  27.46 
 
 		 858 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.87 
 
 		 936 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.85 
 
 		 905 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 		 793 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  24.04 
 
 		 949 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  37.5 
 
 		 568 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.46 
 
 		 585 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  20.1 
 
 		 572 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  22.41 
 
 		 556 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.5 
 
 		 805 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  19.12 
 
 		 873 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1457  hypothetical protein  20.65 
 
 		 641 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>