66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2877 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  40.52 
 
 		 904 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  52.92 
 
 		 901 aa  802    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  51 
 
 		 757 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  49.73 
 
 		 851 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  52.4 
 
 		 844 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  51.99 
 
 		 829 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  44.82 
 
 		 941 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  49.93 
 
 		 763 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  49.59 
 
 		 880 aa  727    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.51 
 
 		 1429 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  49.22 
 
 		 859 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  40.33 
 
 		 909 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  47.57 
 
 		 872 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  44.44 
 
 		 935 aa  671    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  54.23 
 
 		 931 aa  852    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  41 
 
 		 918 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 855 aa  1708    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  41.87 
 
 		 905 aa  682    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  45.36 
 
 		 832 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  45.18 
 
 		 1507 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  48.44 
 
 		 774 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  41.31 
 
 		 858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  40.42 
 
 		 941 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  39.58 
 
 		 895 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.89 
 
 		 899 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  32.67 
 
 		 860 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  32.25 
 
 		 860 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.63 
 
 		 951 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  32.29 
 
 		 860 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  32.3 
 
 		 860 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  42.41 
 
 		 1061 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  38.7 
 
 		 868 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  42.16 
 
 		 971 aa  479  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  34.85 
 
 		 910 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  37.79 
 
 		 773 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  37.67 
 
 		 776 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  31.62 
 
 		 876 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.34 
 
 		 776 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  37.08 
 
 		 1084 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  29.94 
 
 		 910 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  30.33 
 
 		 916 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  31.56 
 
 		 894 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  30.81 
 
 		 1251 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  38.33 
 
 		 873 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.37 
 
 		 926 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.93 
 
 		 1107 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  27.06 
 
 		 923 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  27.57 
 
 		 916 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.24 
 
 		 774 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  30.72 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.97 
 
 		 914 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  21.7 
 
 		 882 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.06 
 
 		 910 aa  144  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.04 
 
 		 733 aa  89  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.7 
 
 		 1118 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  27.73 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  26.45 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.61 
 
 		 1188 aa  67.8  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.67 
 
 		 955 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.25 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.78 
 
 		 883 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 819 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.63 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 770 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>