82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3899 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  100 
 
 		 910 aa  1824    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  39.65 
 
 		 1118 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  40.79 
 
 		 1188 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  29.45 
 
 		 935 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  29.21 
 
 		 941 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  25.98 
 
 		 1251 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 1107 aa  254  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  25.6 
 
 		 910 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  25.55 
 
 		 916 aa  245  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  25.92 
 
 		 918 aa  240  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  25.61 
 
 		 894 aa  235  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  28.32 
 
 		 941 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  24.82 
 
 		 951 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  24.02 
 
 		 916 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  27.07 
 
 		 899 aa  227  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  26.22 
 
 		 876 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  25.26 
 
 		 909 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  26.83 
 
 		 895 aa  220  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  25.51 
 
 		 923 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  25.05 
 
 		 904 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  22.68 
 
 		 926 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  23.44 
 
 		 860 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  23.67 
 
 		 860 aa  177  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 860 aa  177  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  28.25 
 
 		 1084 aa  173  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  27.36 
 
 		 931 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  24.57 
 
 		 793 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  26.77 
 
 		 868 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  25.99 
 
 		 910 aa  151  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  27.45 
 
 		 901 aa  150  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  26.11 
 
 		 801 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  26.06 
 
 		 855 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  26.55 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  27.47 
 
 		 859 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  23.28 
 
 		 774 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.96 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.22 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.91 
 
 		 905 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  26.67 
 
 		 1061 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  25.71 
 
 		 844 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.86 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 		 819 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.4 
 
 		 796 aa  118  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  26.56 
 
 		 851 aa  115  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  24.55 
 
 		 971 aa  114  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.2 
 
 		 1187 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  25.95 
 
 		 763 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 		 832 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  27.23 
 
 		 757 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.49 
 
 		 1429 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  21.85 
 
 		 787 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 880 aa  104  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  25.09 
 
 		 829 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.25 
 
 		 1507 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 755 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  24.29 
 
 		 839 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  24.7 
 
 		 776 aa  94.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 734 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  32.64 
 
 		 955 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  21.34 
 
 		 858 aa  83.2  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  23.13 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  25.11 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  26.72 
 
 		 761 aa  78.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  26.12 
 
 		 774 aa  77  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.97 
 
 		 883 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.44 
 
 		 826 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  20.45 
 
 		 728 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  20.83 
 
 		 770 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  25.41 
 
 		 949 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  23.85 
 
 		 873 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.37 
 
 		 805 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  24.06 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  36.84 
 
 		 1021 aa  61.6  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.85 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  25.29 
 
 		 831 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 773 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  26.45 
 
 		 810 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  25.91 
 
 		 856 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  21.28 
 
 		 836 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 776 aa  44.3  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>