73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1838 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  45.36 
 
 		 855 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  48.6 
 
 		 901 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  46.79 
 
 		 757 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  60.66 
 
 		 851 aa  1014    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  48.01 
 
 		 844 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  56.82 
 
 		 829 aa  939    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 832 aa  1702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  45.17 
 
 		 763 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  47.2 
 
 		 931 aa  709    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  47.1 
 
 		 859 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  44.57 
 
 		 935 aa  631  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  44.74 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  43.29 
 
 		 941 aa  616  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  40.26 
 
 		 904 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  41.24 
 
 		 909 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  41.03 
 
 		 918 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  43.89 
 
 		 880 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  41.37 
 
 		 1507 aa  581  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.92 
 
 		 905 aa  567  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  43.67 
 
 		 774 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  40.46 
 
 		 1429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  39.89 
 
 		 895 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.84 
 
 		 899 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  39.68 
 
 		 941 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.06 
 
 		 860 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  38.69 
 
 		 858 aa  498  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  36.24 
 
 		 951 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.6 
 
 		 860 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.65 
 
 		 860 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  40.79 
 
 		 1061 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  34.04 
 
 		 860 aa  489  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  38.73 
 
 		 971 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  35.65 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  38.64 
 
 		 868 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  35.3 
 
 		 910 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  35.97 
 
 		 776 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.75 
 
 		 773 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  34.01 
 
 		 776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 894 aa  402  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.96 
 
 		 910 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  33.38 
 
 		 1084 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  31.82 
 
 		 916 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  30.91 
 
 		 1251 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  33.95 
 
 		 873 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.7 
 
 		 1107 aa  330  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  29.68 
 
 		 916 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.52 
 
 		 774 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  27.46 
 
 		 923 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 926 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.71 
 
 		 761 aa  201  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.04 
 
 		 914 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 882 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.26 
 
 		 910 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.09 
 
 		 733 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.79 
 
 		 1187 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.69 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.57 
 
 		 728 aa  77.8  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.87 
 
 		 1188 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.94 
 
 		 883 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.34 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.59 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 734 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.34 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.27 
 
 		 801 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 		 572 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  21.6 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.37 
 
 		 793 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.34 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.43 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  32.54 
 
 		 856 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  20.78 
 
 		 585 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.17 
 
 		 831 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  21.58 
 
 		 836 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>