40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0959 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  57.42 
 
 		 572 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 585 aa  1210    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  28.75 
 
 		 728 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  27.66 
 
 		 734 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  26.53 
 
 		 734 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  27.68 
 
 		 831 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  27.19 
 
 		 897 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.57 
 
 		 955 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 796 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.44 
 
 		 801 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 793 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.24 
 
 		 883 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.43 
 
 		 553 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  22.29 
 
 		 787 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  22.54 
 
 		 949 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 		 856 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  25.06 
 
 		 831 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 819 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  20.56 
 
 		 839 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  21.64 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.7 
 
 		 936 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.72 
 
 		 1429 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  41.77 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.46 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  23.82 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.91 
 
 		 755 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.69 
 
 		 775 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  21.85 
 
 		 829 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.95 
 
 		 770 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  21.23 
 
 		 832 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 910 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.03 
 
 		 1187 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 941 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.86 
 
 		 905 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  20.22 
 
 		 1188 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  38.6 
 
 		 826 aa  47.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  21.59 
 
 		 1107 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  21.86 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  24.84 
 
 		 876 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>