58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2303 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 572 aa  1183    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  57.42 
 
 		 585 aa  674    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  30.36 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  27.94 
 
 		 734 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  27.88 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  27.09 
 
 		 831 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 955 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  25.7 
 
 		 897 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.51 
 
 		 801 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  22.55 
 
 		 796 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  23.4 
 
 		 787 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  25.96 
 
 		 883 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  22.44 
 
 		 949 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  24.84 
 
 		 819 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.01 
 
 		 793 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.24 
 
 		 839 aa  90.1  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  21.88 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 856 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  24.14 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  28.86 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 936 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.05 
 
 		 1429 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.88 
 
 		 826 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20.42 
 
 		 1118 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  29.41 
 
 		 831 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.45 
 
 		 1507 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  20.57 
 
 		 1187 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 		 832 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  18.4 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  26.84 
 
 		 770 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  19.61 
 
 		 1188 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  22.47 
 
 		 844 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  19.85 
 
 		 763 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  20.08 
 
 		 931 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  23.11 
 
 		 910 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 851 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  21.1 
 
 		 793 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  21.21 
 
 		 829 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 859 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  21.23 
 
 		 757 aa  50.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 876 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.81 
 
 		 905 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  22.1 
 
 		 858 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  20.1 
 
 		 733 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 918 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 880 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  21.36 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 		 904 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  19.3 
 
 		 836 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  21.25 
 
 		 872 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  26.04 
 
 		 901 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  27.27 
 
 		 951 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  30.1 
 
 		 776 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  21.41 
 
 		 1084 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  23.52 
 
 		 868 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  29.35 
 
 		 941 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  22.66 
 
 		 941 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  23.28 
 
 		 556 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>