16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10277 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  100 
 
 
661 aa  1343    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  41.21 
 
 
897 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  28.61 
 
 
856 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  29.03 
 
 
883 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  31.47 
 
 
831 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.24 
 
 
728 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.95 
 
 
955 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  24.14 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  20.97 
 
 
734 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21 
 
 
734 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.53 
 
 
585 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
556 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  20.87 
 
 
793 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  26.21 
 
 
353 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.41 
 
 
936 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  19.89 
 
 
775 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>