70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4246 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  55.38 
 
 		 801 aa  858    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 793 aa  1650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  44.82 
 
 		 819 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  47.71 
 
 		 796 aa  776    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  42.41 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  36.74 
 
 		 775 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  34.27 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  34.32 
 
 		 839 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  33.01 
 
 		 836 aa  330  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  30.86 
 
 		 805 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 793 aa  313  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.88 
 
 		 1187 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.4 
 
 		 826 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  27.42 
 
 		 955 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  25.4 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.35 
 
 		 910 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25.52 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.8 
 
 		 734 aa  134  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  26.41 
 
 		 949 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.39 
 
 		 770 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  22.51 
 
 		 876 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  21.08 
 
 		 926 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  20.54 
 
 		 916 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  21.01 
 
 		 572 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  22.83 
 
 		 585 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 1188 aa  89.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.8 
 
 		 774 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 1084 aa  84.3  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 936 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  23.82 
 
 		 831 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 918 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.72 
 
 		 883 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  21.58 
 
 		 935 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  21.64 
 
 		 1251 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  22.53 
 
 		 1107 aa  74.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 		 941 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 1118 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  22.61 
 
 		 1061 aa  70.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.96 
 
 		 914 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  22.19 
 
 		 916 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.88 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  22.37 
 
 		 894 aa  70.1  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  21.59 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  20.95 
 
 		 910 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  21.33 
 
 		 909 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.9 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  23.52 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  24.42 
 
 		 941 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  21.69 
 
 		 923 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 859 aa  62  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.85 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.76 
 
 		 831 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 895 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  23.79 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  22.48 
 
 		 757 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 		 931 aa  54.7  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  21.45 
 
 		 901 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  22.35 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  21.61 
 
 		 851 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.12 
 
 		 1429 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  20.87 
 
 		 661 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  21.73 
 
 		 971 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  20.51 
 
 		 905 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  22.57 
 
 		 763 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  20.78 
 
 		 829 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  21 
 
 		 832 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  21.01 
 
 		 899 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  25.2 
 
 		 872 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>