68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2047 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  43.59 
 
 		 1429 aa  662    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  49.94 
 
 		 855 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  53.81 
 
 		 931 aa  772    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.55 
 
 		 935 aa  665    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  52.55 
 
 		 872 aa  774    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 859 aa  1664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  51.8 
 
 		 880 aa  731    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  48.34 
 
 		 763 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  43.91 
 
 		 941 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  51.98 
 
 		 829 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  53.73 
 
 		 844 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  48.3 
 
 		 851 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  50.95 
 
 		 757 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  56.37 
 
 		 901 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.7 
 
 		 905 aa  668    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  44.68 
 
 		 1507 aa  675    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  39.95 
 
 		 904 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  47.31 
 
 		 832 aa  629  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  41.95 
 
 		 941 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  38.54 
 
 		 918 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  37.28 
 
 		 909 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  40.45 
 
 		 858 aa  590  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  46.83 
 
 		 774 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  43.01 
 
 		 899 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  42.12 
 
 		 895 aa  554  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.18 
 
 		 860 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.06 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.02 
 
 		 860 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  32.68 
 
 		 860 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  45.23 
 
 		 1061 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  42.59 
 
 		 868 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  37.92 
 
 		 910 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  31.81 
 
 		 951 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  42.4 
 
 		 971 aa  442  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.8 
 
 		 894 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.36 
 
 		 876 aa  422  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.37 
 
 		 910 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.12 
 
 		 776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  29.97 
 
 		 916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  30.97 
 
 		 1251 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  39.66 
 
 		 873 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.47 
 
 		 773 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  37.04 
 
 		 1084 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.07 
 
 		 776 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  33.29 
 
 		 1107 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  28.31 
 
 		 916 aa  336  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.47 
 
 		 923 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  29.12 
 
 		 774 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  24.8 
 
 		 926 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.8 
 
 		 914 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  31.15 
 
 		 761 aa  224  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  21.71 
 
 		 882 aa  154  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  27.53 
 
 		 910 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  25.38 
 
 		 770 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  25.25 
 
 		 1188 aa  84.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  24.02 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  25.23 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.35 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.21 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.65 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 955 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.64 
 
 		 1187 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  24.94 
 
 		 826 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  26.19 
 
 		 757 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 572 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.26 
 
 		 755 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.14 
 
 		 839 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  32.82 
 
 		 856 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>