70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2759 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  49.51 
 
 		 923 aa  913    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 916 aa  1888    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  42.16 
 
 		 926 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  34.16 
 
 		 935 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  34.88 
 
 		 910 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  34.93 
 
 		 941 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  33.15 
 
 		 895 aa  502  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  34.14 
 
 		 918 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  33.69 
 
 		 1251 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  34.18 
 
 		 916 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 894 aa  487  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  32.94 
 
 		 899 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.36 
 
 		 876 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  33.26 
 
 		 909 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  32.89 
 
 		 951 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  33.16 
 
 		 904 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  29.84 
 
 		 941 aa  432  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  31.44 
 
 		 860 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  31.06 
 
 		 860 aa  426  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  30.16 
 
 		 860 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  31.17 
 
 		 860 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  29.66 
 
 		 971 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.81 
 
 		 1107 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  32.38 
 
 		 774 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  30.53 
 
 		 1084 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  30.35 
 
 		 868 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  27.93 
 
 		 931 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  32.68 
 
 		 761 aa  364  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  30.18 
 
 		 1061 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  29.04 
 
 		 914 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  30.75 
 
 		 829 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  27.19 
 
 		 901 aa  331  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  28.31 
 
 		 859 aa  330  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.8 
 
 		 905 aa  318  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  29.5 
 
 		 851 aa  318  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  27.57 
 
 		 855 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  29.68 
 
 		 832 aa  316  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  27.93 
 
 		 910 aa  307  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  28.05 
 
 		 844 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  29.02 
 
 		 763 aa  299  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  26.51 
 
 		 872 aa  296  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  27.74 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  27.14 
 
 		 1507 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  25.94 
 
 		 880 aa  278  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  26.22 
 
 		 776 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  26.47 
 
 		 773 aa  268  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.14 
 
 		 1429 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  26.1 
 
 		 858 aa  250  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.26 
 
 		 910 aa  239  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  25.54 
 
 		 873 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  25.78 
 
 		 776 aa  235  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  26.8 
 
 		 882 aa  233  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  23.98 
 
 		 774 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.46 
 
 		 1188 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.14 
 
 		 1187 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.9 
 
 		 757 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  22.97 
 
 		 1118 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.58 
 
 		 733 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 		 883 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.24 
 
 		 755 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.19 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  20.34 
 
 		 796 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  20.65 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  38.89 
 
 		 1021 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  22.96 
 
 		 936 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  23.48 
 
 		 734 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.93 
 
 		 770 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  21.44 
 
 		 856 aa  52  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  25.39 
 
 		 568 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  22.15 
 
 		 831 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>