65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0243 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  42.59 
 
 
895 aa  694    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 
971 aa  1911    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  40.21 
 
 
941 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  42.9 
 
 
899 aa  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  35.73 
 
 
909 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  39.79 
 
 
935 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  38.89 
 
 
918 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.47 
 
 
951 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  47.25 
 
 
1061 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  42.2 
 
 
868 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 
904 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  36.85 
 
 
941 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  33.5 
 
 
860 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  33.09 
 
 
860 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  33.5 
 
 
860 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.13 
 
 
860 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  32.99 
 
 
894 aa  508  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  42.28 
 
 
901 aa  505  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  40.41 
 
 
931 aa  496  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 
916 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  42.44 
 
 
855 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.2 
 
 
910 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  41.25 
 
 
829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  42.4 
 
 
859 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  39.76 
 
 
763 aa  446  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  41.94 
 
 
873 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  38.73 
 
 
832 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  30.93 
 
 
876 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  30.78 
 
 
1251 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  40.45 
 
 
844 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.96 
 
 
905 aa  435  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  40.16 
 
 
757 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  29.77 
 
 
916 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  39.01 
 
 
851 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  27.19 
 
 
926 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.39 
 
 
776 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  37.97 
 
 
872 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  36.42 
 
 
1084 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  33.58 
 
 
910 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.65 
 
 
773 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  37.25 
 
 
880 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.01 
 
 
1429 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  39.27 
 
 
774 aa  396  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.57 
 
 
1507 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.24 
 
 
1107 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  33.52 
 
 
858 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  34.58 
 
 
776 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.35 
 
 
923 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.26 
 
 
774 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  25.17 
 
 
914 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  31.87 
 
 
761 aa  231  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  21.7 
 
 
882 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.98 
 
 
910 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  25.24 
 
 
826 aa  81.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  25.54 
 
 
733 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 
955 aa  69.3  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.42 
 
 
1187 aa  64.7  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  27.58 
 
 
1118 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 
1188 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.73 
 
 
770 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.49 
 
 
755 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.73 
 
 
793 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  22.41 
 
 
801 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  25.1 
 
 
757 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  29.91 
 
 
883 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>